公司全体职员违法，公司作为雇主应首先明确违法行为的性质与责任，并依据相关法律法规采取相应措施。
一. 明确违法行为的性质与责任
- 分析违法行为：全体职员违法可能涉及多种情况，如违反公司规章制度、违反劳动合同、甚至触犯刑法等。公司需首先通过内部调查或聘请外部专业机构，明确违法行为的性质、程度及影响。
- 界定责任：根据违法行为的性质，界定是公司职员个人责任、公司管理责任，还是两者兼有。这将影响后续的处理措施和法律责任承担。
二. 依据法律法规采取相应措施
内部处理：
- 对于违反公司规章制度的行为，公司可依据《员工手册》或相关规章制度进行处罚，如警告、罚款、降职、解雇等。
- 若违法行为导致公司经济损失，根据《中华人民共和国劳动法》第一百零二条，劳动者违反本法规定的条件解除劳动合同或者违反劳动合同中约定的保密事项，对用人单位造成经济损失的，应当依法承担赔偿责任。公司可要求违法职员赔偿相应损失。
外部法律责任：
- 若职员违法行为触犯刑法，如诈骗、贪污等，公司应积极配合司法机关调查，提供必要证据。
- 对于组织、领导或参与犯罪集团的职员，根据《中华人民共和国刑法》第二十六条，将依法承担刑事责任。公司需与司法机关保持沟通，确保法律程序顺利进行。
三. 后续管理与预防
- 加强内部管理：公司应反思此次全体职员违法事件，加强内部管理，完善规章制度，提高员工法律意识。
- 培训与教育：定期组织员工参加法律培训，增强员工的法制观念和职业道德。
我建议，公司在处理全体职员违法事件时，应保持冷静，依法依规处理。同时，加强内部管理，预防类似事件再次发生。如有进一步需要，您可以继续咨询我。