签署补偿协议并拿到赔偿金后，您仍然有权起诉公司关于公积金的问题。

根据《住房公积金管理条例》，单位应当按时足额缴存住房公积金。如果公司未足额为您缴纳住房公积金，您完全有权向住房公积金管理中心进行投诉，并要求公司进行相应的补缴。这一权益与您是否签署裁员协议书或是否已拿到补偿金无关。

具体操作步骤如下：

1. 收集证据：首先，您需要准备一些必要的证据，如工资条、住房公积金的缴纳记录等，这些都可以作为您投诉时的有力依据。
2. 提交投诉材料：接着，您可以向住房公积金管理中心提交投诉材料，其中应包括您收集到的证据以及详细的情况说明。
3. 等待管理中心调查处理：管理中心在收到您的投诉后，会进行调查。如果调查发现公司确实存在未足额缴纳住房公积金的情况，管理中心将责令公司进行补缴。
4. 申请强制执行：如果公司在被责令补缴后仍然不执行，您可以向人民法院申请强制执行，以确保您的权益得到保障。

总的来说，签署补偿协议并不妨碍您维护自己在住房公积金方面的合法权益。如果您发现公司存在未足额缴纳的情况，建议及时采取行动，以保障自己的利益。