关于您提出的问题“要求员工退还其个人社保部分是否必须通过劳动仲裁”，这并非一个绝对的答案，而是需要根据具体情况和当地的司法实践来决定。

首先，从法律层面来看，用人单位和劳动者都有义务按照规定的比例共同缴纳社会保险费。如果用人单位已经为劳动者全额补缴了社会保险费用，其中包括了应由劳动者个人承担的部分，那么劳动者理应向用人单位返还这部分费用。这一点在《中华人民共和国社会保险法》中也有明确规定。

然而，在实际操作中，如果用人单位要求员工退还其个人社保部分，是否需要通过劳动仲裁来处理，这在不同地区可能存在差异。一些地区的法院可能会以劳动争议为案由来受理此类案件，而另一些地区则可能会以不当得利为案由来受理。

• 如果以劳动争议为案由，那么用人单位需要在补缴社会保险费后的一年内提起仲裁，因为劳动争议的仲裁时效通常为一年。如果仲裁机构认为不属于劳动争议并出具了不予受理通知书，用人单位可以凭此向人民法院提起诉讼。
• 如果以不当得利为案由，那么诉讼时效通常为三年。用人单位可以在补缴社会保险费后的三年内向人民法院提起诉讼。

因此，具体是否需要通过劳动仲裁来处理，取决于当地的司法实践和具体情况。建议用人单位在遇到此类问题时，先咨询当地的法律专业人士或劳动部门，了解当地的法律规定和实践做法，然后再根据具体情况来决定如何操作。

总的来说，要求员工退还其个人社保部分并不一定必须通过劳动仲裁，但需要根据当地法律规定和实践来做出决定。同时，用人单位也应该加强内部管理，确保及时、足额地为员工缴纳社会保险费用，避免类似问题的发生。