若员工不同意将标准工时工作制变更为综合计算工时工作制，并因此解除劳动合同，用人单位可能面临承担经济补偿等法律责任。以下是对此问题的详细分析：

一. 合同工时变更需经协商一致

1. 法律规定：根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动合同的变更应当经用人单位与劳动者协商一致。若未经协商一致，单方面变更劳动合同内容可能构成违约。
2. 实际应用：在本案例中，若用人单位欲将标准工时工作制变更为综合计算工时工作制，必须首先与员工进行协商，并达成一致意见。

二. 员工不同意变更的后果

1. 员工权利：若员工不同意工时制度的变更，他们有权要求继续按照原劳动合同约定的工时制度执行。
2. 解除劳动合同：若用人单位坚持变更工时制度，而员工无法接受这一变更，员工有权选择解除劳动合同。此时，用人单位可能需要根据法律规定向员工支付经济补偿。

三. 经济补偿的支付

1. 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，若用人单位违反法律规定解除或变更劳动合同，导致劳动者解除劳动合同的，用人单位应当向劳动者支付经济补偿。
2. 计算方式：经济补偿的计算通常基于劳动者在用人单位的工作年限和月工资水平。具体计算方式可参照相关法律规定或劳动合同中的约定。

四. 合规建议

1. 协商沟通：我建议用人单位在变更工时制度前，务必与员工进行充分的协商沟通，确保双方能够达成一致意见。
2. 遵守法律规定：用人单位应严格遵守《中华人民共和国劳动合同法》等相关法律法规的规定，确保劳动合同变更的合法性和合规性。
3. 风险防控：对于可能因工时制度变更而引发的劳动争议，用人单位应提前做好风险防控措施，如制定应急预案、准备相关法律文件等。

综上所述，若员工不同意将标准工时工作制变更为综合计算工时工作制，并因此解除劳动合同，用人单位可能需要承担经济补偿等法律责任。因此，我建议用人单位在变更工时制度时务必遵循法律规定，与员工进行充分协商，并确保变更的合法性和合规性。如有进一步需要，您可以继续咨询我。