企业实施综合工时制需要准备一系列文件和证据。具体来说：

一. 所需文件和证据清单

1. 企业实行综合计算工时工作制的请示和申报表：这是申请的基础文件，需明确表明企业希望实施综合工时制的意愿，并填写相关的申报表格。

   • 例如，这就像是一份申请书，企业需要向相关部门表达其希望采用综合工时制的意愿，并填写相应的表格以提供基本信息。

2. 企业法人营业执照复印件（加盖公章）：这是证明企业合法存在的文件，也是申请过程中必须提供的。

   • 例如，就像个人申请某些服务时需要提供身份证一样，企业在申请综合工时制时也需要提供其“身份证”——营业执照。

3. 企业实行综合计算工时工作制的实施方案：该方案应详细阐述实行综合工时制的具体工种或岗位、职工数量、实施周期、申请期限、工资支付和休息休假办法、劳动保护和安全卫生条件措施等。

   • 例如，企业需要明确哪些岗位将实行综合工时制，员工数量是多少，实施周期是多久，以及如何确保员工的工资和休息休假权益。

4. 企业职工代表大会（职工大会）或者工会组织对实行综合计算工时工作制实施方案的书面意见以及公示情况的报告：这表示企业已经就实施方案与员工代表或工会进行了沟通，并得到了他们的书面意见，同时方案也已经在企业内部进行了公示。

   • 例如，企业不能单方面决定实施综合工时制，而需要与员工代表或工会进行协商，并听取他们的意见。

5. 综合计算工时工作制工种岗位人员花名册：如果企业实行不定时工作制，该花名册还应经职工签名认可。

   • 例如，企业需要提供一份清单，列出所有将实行综合工时制的员工，如果是不定时工作制，还需要员工签名确认。

6. 实施周期期满企业再次申请的，应当书面报告原实施方案的执行情况：如果企业之前已经实施过综合工时制，并在实施周期结束后希望继续实施，那么需要提供原实施方案的执行情况报告。

   • 例如，就像一份工作总结，企业需要回顾并总结上一次实施综合工时制的情况，以便为下一次申请提供依据。

7. 企业的劳动用工备案记录：这是证明企业劳动用工情况的文件，也是申请过程中需要提供的。

   • 例如，企业需要提供其劳动用工的备案记录，以证明其用工的合法性和规范性。

8. 涉及劳务派遣人员的，应提供劳动力派遣单位书面意见：如果企业使用劳务派遣人员，并且希望他们也实行综合工时制，那么需要提供劳务派遣单位的书面意见。

   • 例如，如果企业有劳务派遣员工，那么需要得到劳务派遣单位的同意，才能将这些员工也纳入综合工时制的范围。

二. 办理流程

1. 提出申请：企业需要将上述所有文件和证据提交给相关部门进行申请。
2. 业务处室审查：相关部门会对企业的申请进行审查，决定是否受理。
3. 调查核实：如果受理，相关部门会依法进行调查核实，以确保企业提供的文件和证据的真实性和合法性。
4. 作出是否许可的决定：最后，相关部门会根据调查核实的结果，作出是否许可企业实施综合工时制的决定。

综上所述，企业实施综合工时制需要准备一系列文件和证据，并按照一定的流程进行申请。如有进一步需要，您可以继续咨询我。