针对您提出的“民事诉讼员工离职怎么办”的问题，这实际上涉及了员工离职后可能面临的一系列法律问题和应对措施。以下是对此问题的详细解答：

一、明确离职原因与流程

首先，员工离职应明确离职原因，并按照公司规定或劳动合同约定的流程进行。这通常包括提前通知用人单位、完成工作交接、办理离职手续等。如果是因为公司违法或违约导致员工离职，员工还有权要求经济补偿。

二、处理与公司之间的法律纠纷

1. 劳动合同解除：如果公司未按照法律规定或合同约定解除劳动合同，员工可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求确认解除劳动合同的效力，并可能获得经济补偿。

2. 社保与公积金：离职后，员工应确保公司为其办理社保和公积金的转移或停缴手续。如果公司未按规定办理，员工可以向社保或公积金管理部门投诉，并要求公司补缴。

3. 工资与奖金：离职时，员工应与公司结清所有工资、奖金、加班费等。如果公司拖欠或克扣，员工可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求公司支付。

4. 法定代表人身份：如果员工在职期间被登记为公司的法定代表人，离职后应要求公司及时办理工商变更登记，摘除其法定代表人身份。如果公司不配合，员工可以向法院提起诉讼，请求变更公司登记。

三、保护个人权益

1. 保留证据：在离职过程中，员工应保留所有与公司沟通的记录、劳动合同、工资单、离职证明等证据，以备不时之需。

2. 主张权益的时效：员工应注意劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从知道或应当知道其权利被侵害之日起计算。如果因特殊情况无法及时申请，应寻求时效中止或中断的理由。

3. 寻求法律援助：如果员工在离职过程中遇到复杂的法律问题或纠纷，可以寻求专业律师的帮助，以维护自己的合法权益。

四、特殊情况的离职

对于因家庭原因或其他紧急情况需要提前离职的员工，建议与用人单位协商，寻求双方都能接受的解决方案。同时，员工应了解并遵守劳动合同中关于离职的特别约定。

综上所述，员工离职时应明确离职原因与流程，处理与公司之间的法律纠纷，保护个人权益，并在特殊情况下与用人单位协商离职事宜。如果遇到复杂的法律问题或纠纷，应及时寻求专业律师的帮助。