以发工资的模式结工程款，通常并不能确保工程款能全部结清。下面我来详细解释一下这个问题：
首先，我们要明确“发工资”和“结工程款”是两个不同的法律概念，它们分别对应着不同的法律关系和支付义务。
发工资：这是基于劳动关系，用人单位向劳动者支付劳动报酬的行为。工资是劳动者提供劳动后应得的报酬，其支付通常受到劳动法律法规的严格规范。
结工程款：这是基于建设工程施工合同，发包人向承包人支付工程价款的行为。工程款是承包人完成工程建设后应得的报酬，其支付通常受到合同法、建筑法等法律法规的规范。
以发工资的模式来结工程款，可能会存在以下问题：
法律性质不符：工资和工程款在法律性质上是不同的，它们分别对应着不同的法律关系和支付义务。将工程款以工资的形式发放，可能会混淆这两种法律关系，导致法律纠纷。
税务问题：工资和工程款在税务处理上也是不同的。如果以发工资的模式结工程款，可能会引发税务风险，如偷税、漏税等。
支付保障不足：工程款通常涉及较大的金额，且支付周期较长。如果以发工资的模式来支付，可能会因为支付频率、支付金额等限制，导致工程款无法及时、足额支付。
因此，我建议你在处理工程款支付问题时，应严格按照合同法和建筑法等法律法规的规定进行，确保工程款的支付合法、合规。如果遇到工程款支付纠纷，可以及时向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议。