住院期间单位通知不续签合同，单位的做法可能涉及违法解除劳动合同，具体需根据医疗期情况判断。以下是对此问题的详细分析：
若员工在规定的医疗期内：
- 单位不续签合同属于违法解除劳动合同。根据相关法律规定，用人单位应按照经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。
- 经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
- 这里的月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。
若员工医疗期已满：
- 单位依法可以不续签合同，但需支付经济补偿金，支付标准按照上述每满一年支付一个月工资等规定执行。
- 若单位未提前三十日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付劳动者一个月工资的，还需按照规定支付相应的代通知金。
综上所述，住院期间单位通知不续签合同，员工应首先确认自己是否处于医疗期内。若处于医疗期内，单位不续签则属于违法解除，员工有权要求单位支付二倍经济补偿金；若医疗期已满，单位虽可依法不续签，但仍需支付经济补偿金，并可能需支付代通知金。员工应依据自身实际情况，依法维护自身合法权益。如有进一步疑问或需要法律帮助，请直接向我咨询。