当员工在公司盗窃金额达到5000元时，这通常已经构成了盗窃罪中的“数额较大”标准。根据我国的刑法规定，此种情况下，员工一般会被判处三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并可能会并处罚金，也有可能单独判处罚金。

不过，具体的量刑并非仅仅由盗窃金额决定，还会综合考量多种因素。以下是一些可能影响量刑的具体因素：

1. 自首与立功：

   • 如果员工在盗窃后有主动向司法机关投案自首的行为，或者在案件中有立功表现，如协助司法机关侦破其他案件，这通常会被视为有悔改态度，从而在量刑时予以从轻考虑。

2. 初犯与偶犯：

   • 对于初犯或者偶犯，即员工是第一次或者偶尔实施盗窃行为，相较于多次盗窃的员工，可能会得到相对较轻的处罚。

3. 退赃与谅解：

   • 如果员工或其家属积极将盗窃的财物退还给公司，并且得到了公司的谅解，这在量刑时也会被酌情从轻处理。

4. 犯罪前科与累犯：

   • 如果员工有犯罪前科或者属于累犯，即之前已经因犯罪被判过刑，再次实施盗窃行为时，可能会面临更重的处罚。

5. 公司内部规定：

   • 此外，还需要考虑公司内部的相关规定。有些公司可能有更为严格的内部惩处制度，这些规定也可能会在一定程度上影响对员工的最终处理。

综上所述，员工在公司盗窃金额达到5000元时，具体的量刑结果会由法院根据案件的实际情况和上述多种因素进行综合判断。因此，无法给出一个确定的量刑结果，但可以确定的是，员工将面临法律的制裁。为了避免此类情况的发生，员工应当严格遵守法律和公司的规定，维护自身和公司的合法权益。