关于“公司原因变更劳动合同主体，赔偿金由两个公司分别承担”的问题，我可以给出以下分析：
核心结论：在公司原因变更劳动合同主体的情况下，若赔偿金由两个公司分别承担，需要明确赔偿金的分配方式、具体数额以及各自的承担责任，并确保这一安排符合法律法规的要求，同时保障劳动者的合法权益。
分析说明：
劳动合同主体的变更：
- 劳动合同主体的变更通常涉及用人单位的更换，这可能是由于公司重组、并购、分立等原因导致的。
- 变更劳动合同主体需要遵循法律法规的规定，并确保劳动者的合法权益不受损害。
赔偿金的承担：
- 在劳动合同主体变更的情况下，如果劳动者因此遭受了损失，如工资、福利、补偿金等，那么相关公司应当承担相应的赔偿责任。
- 赔偿金的具体数额和分配方式应由相关公司根据劳动者的实际损失和法律法规的要求进行协商确定。
法律法规的遵循：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》等相关法律法规，用人单位在变更劳动合同主体时，应当与劳动者协商一致，并确保劳动者的合法权益不受损害。
- 如果赔偿金由两个公司分别承担，那么这两个公司应当共同制定赔偿方案，并明确各自的承担责任和赔偿数额。
劳动者的权益保障：
- 劳动者在劳动合同主体变更过程中，应当关注自己的合法权益是否得到保障。
- 如果赔偿金由两个公司分别承担，劳动者有权要求这两个公司明确赔偿金的分配方式和具体数额，并确保自己的损失得到充分补偿。
建议：
- 在劳动合同主体变更前，劳动者应当与用人单位进行充分协商，明确变更后的劳动合同条款和条件。
- 如果赔偿金由两个公司分别承担，劳动者应当要求这两个公司共同制定详细的赔偿方案，并明确各自的承担责任和赔偿数额。
- 如果在劳动合同主体变更或赔偿金承担方面存在争议，劳动者可以依法向劳动争议仲裁机构或人民法院申请仲裁或提起诉讼。
总之，在公司原因变更劳动合同主体的情况下，赔偿金由两个公司分别承担是一个复杂的问题，需要综合考虑法律法规、劳动者的权益保障以及相关公司的实际情况。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。