两个公司主体法律意义上没有关联时，劳动合同的变更需遵循特定程序和法律规定，不能随意变更。以下从不同角度为您详细分析：
一、劳动合同主体变更的合法情形
用人单位合并或分立：
- 当用人单位出现合并或分立等状况时，原劳动合同依然有效，由承继其权利和义务的用人单位继续履行，无需重新签订合同。但这一情形仅适用于有关联的公司主体之间，如A公司与B公司合并成C公司，原来A公司与员工签订的劳动合同由C公司继续执行。由于您提到的是两个没有关联的公司主体，所以这一情形并不适用。
用人单位与劳动者协商一致变更：
- 若两个没有关联的公司主体（即新用人单位）希望与劳动者变更劳动合同主体，必须与劳动者协商一致，并遵循特定程序。
- 签订书面协议：双方需签订书面协议，详细明确变更后的主体信息（如公司名称、地址等），以及工作岗位、薪资待遇等关键条款。
- 双方签字或盖章确认：变更协议必须经双方签字或盖章确认，以保证意思表示真实。
- 新主体具备合法用工资格：变更后的主体要具备合法用工资格，否则变更无效。
二、劳动合同主体变更的注意事项
保障劳动者合法权益：
- 在变更劳动合同主体时，必须确保劳动者的合法权益不受侵害。新主体要承接原主体在劳动合同中的权利义务，防止劳动者因主体变更而利益受损。
避免违法变更：
- 未经劳动者同意，用人单位不得擅自变更劳动合同主体。否则，劳动者有权拒绝，并可能要求用人单位承担违约责任。
三、实际操作建议
与劳动者充分沟通：
- 在变更劳动合同主体前，新用人单位应与劳动者进行充分沟通，解释变更的原因、目的和具体安排，争取劳动者的理解和同意。
遵循法定程序：
- 严格按照法定程序进行变更，包括签订书面协议、双方签字或盖章确认等。避免因程序瑕疵导致变更无效。
咨询专业律师：
- 由于劳动合同主体变更涉及复杂的法律问题和程序要求，建议新用人单位在变更前咨询专业律师，以确保变更的合法性和有效性。不过，您现在就可以直接向我咨询相关法律问题，我会为您提供专业的法律意见。
举例说明：假设D公司（原用人单位）与E公司（新用人单位）没有关联，D公司希望将某员工的劳动合同主体变更为E公司。此时，D公司必须与该员工协商一致，并签订书面协议明确变更后的主体信息、工作岗位、薪资待遇等关键条款。协议必须经双方签字或盖章确认，且E公司要具备合法用工资格。只有这样，变更才是合法有效的。