工程风险抵押金在一定条件下是合法的。其合法性取决于具体的实施方式、应用场景以及是否符合相关法律法规的规定。以下是对工程风险抵押金合法性的详细分析：

1. 合法情况：

   • 商业合作中的约定：在工程承包、施工等商业合作中，如果双方基于平等自愿、协商一致的原则，在合同中明确约定一方支付风险抵押金以担保合同的履行或保障可能出现的损失赔偿，这种约定通常是合法有效的。这种情况下，风险抵押金作为合同的一部分，具有法律约束力。
   • 特定行业的规定：在某些特定行业，如建筑施工领域，为了保障工程质量、安全以及农民工的工资支付，相关法律法规或政策可能允许或要求企业设立风险抵押金制度。只要这种制度的设立和使用符合法律法规的规定，并经过了相关监管部门的批准，就是合法的。

2. 不合法情况：

   • 违反劳动合同法：如果用人单位以风险抵押金的名义向劳动者收取财物，且该行为违反了《中华人民共和国劳动合同法》第九条的强制性规定（即用人单位不得要求劳动者提供担保或以其他名义向劳动者收取财物），那么这种行为是不合法的。
   • 未经过法定程序：风险抵押金的收取和使用通常需要遵循一定的法定程序。如果用人单位或相关方未经过法定程序擅自收取或使用风险抵押金，那么这种行为也是不合法的。

3. 注意事项：

   • 明确约定：在签订合同时，双方应明确约定风险抵押金的相关条款，包括金额、用途、退还方式等，以避免后续产生纠纷。
   • 合规性审查：在使用风险抵押金前，建议咨询专业律师或相关监管部门，确保其合法性并避免潜在的法律风险。
   • 遵守法律法规：无论风险抵押金在何种情况下使用，都必须严格遵守相关法律法规的规定，不得侵犯他人的合法权益。

综上所述，工程风险抵押金的合法性需要根据具体情况来判断。在符合法律法规和合同约定的前提下，风险抵押金是合法的；但如果违反了相关法律法规或合同约定，那么这种行为就是不合法的。因此，在使用风险抵押金时，应谨慎对待并确保其合法性。