公司大量虚开发票被查到，责任归属是一个涉及多方面因素的问题，通常需要根据具体情况来分析。但一般来说，责任会落在直接负责的主管人员及其他直接责任人员身上。以下是对这一问题的详细解答：
一、责任人员分类及责任界定
直接负责的主管人员：
- 法定代表人：如果法定代表人知晓并默许、指示或参与决策虚开发票行为，那么他将需要承担法律责任。例如，在会议上示意财务人员通过虚开发票来降低成本、增加利润，或者对虚开发票行为视而不见、未加制止，都可能被视为责任主体。
- 财务负责人：作为公司财务工作的整体规划和管理者，如果财务负责人组织、策划或参与虚开发票活动，同样需要承担法律责任。比如，为了粉饰财务报表而指使会计人员虚开发票，或者对虚开发票行为提供便利、隐瞒不报，都可能被追究责任。
- 经营负责人：负责公司的日常经营事务的经营负责人，如果为了公司业绩或个人利益安排员工虚开发票，也会被认定为责任主体。例如，业务部门负责人要求财务部门配合虚开发票以虚构交易，或者对下属员工的虚开发票行为未加制止、默许其存在，都可能承担法律责任。
其他直接责任人员：
- 会计人员：会计人员直接操作发票开具和账务处理工作，如果明知是虚开发票仍进行相关操作，那么他们需要承担责任。例如，按照上级要求在没有真实业务发生的情况下开具增值税专用发票，或者对虚开发票行为进行隐瞒、不报告，都可能被追究责任。
- 开票人员：具体负责开具发票的岗位人员，如果违反规定开具虚假发票，也将被追究责任。比如，未核实业务真实性即随意开具发票，或者对虚开发票行为不加以核实、直接开具，都可能构成违法。
二、特殊情况下的责任归属
- 如果员工背着公司独自进行虚开发票行为，且公司对此毫不知情，那么主要责任将由该员工承担。但公司仍需加强内部管理，防止类似事件再次发生。
- 如果公司因管理不善导致他人有机会虚开发票，比如发票管理不严格、内部控制存在漏洞等，那么公司也可能因未尽到管理职责而承担一定的责任。这种情况下，公司需要完善管理制度、加强内部控制，以确保类似问题不再出现。
三、法律责任承担方式
对于公司虚开发票行为，法律责任主要包括行政责任和刑事责任两种：
- 行政责任：根据《中华人民共和国发票管理办法》，虚开发票的，税务机关将没收违法所得；虚开金额在1万元以下的，可并处5万元以下罚款；虚开金额超过1万元的，处5万元以上50万元以下罚款。此外，还可能面临税务机关的其他行政处罚措施，如暂停供应发票、吊销发票准购证等。
- 刑事责任：依据《中华人民共和国刑法》，虚开增值税专用发票或用于骗取出口退税、抵扣税款的其他发票的，将可能面临三年以下有期徒刑或拘役，并处2万元以上20万元以下罚金的处罚；如果虚开的税款数额较大或有其他严重情节，还可能面临更严厉的刑事处罚，包括三年以上十年以下有期徒刑，并处5万元以上50万元以下罚金等。对于单位犯罪，还会对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员依法处罚。
综上所述，公司大量虚开发票被查到后，责任归属需要根据具体情况来分析，但通常包括直接负责的主管人员及其他直接责任人员。在实际操作中，应依据相关法律法规进行具体分析，以确保法律责任的准确界定和承担。同时，公司也应加强内部管理、完善控制制度，以防止类似问题的发生。