在劳动仲裁期间，公司不能停发员工工资。下面我将从几个方面详细解释这一结论：

1. 法律规定：

   • 根据相关法律法规，只要劳动关系还存续，且劳动者正常提供劳动，用人单位就有义务依照劳动合同约定和国家规定，及时、足额向劳动者支付劳动报酬。
   • 若因拖欠劳动报酬产生争议，劳动者申请仲裁不受时效限制，且用人单位在仲裁期间仍需承担工资支付责任。

2. 公司停发工资的应对办法：

   • 沟通协商：首先，劳动者可以与公司进行沟通协商，明确要求公司恢复工资发放，并指出公司停发工资行为的违法性。
   • 投诉举报：若协商无果，劳动者可以向劳动监察部门进行投诉，由该部门责令公司支付工资。
   • 仲裁请求：在仲裁过程中，劳动者可以进一步要求公司支付拖欠的工资以及相应的赔偿金。

3. 特殊情况说明：

   • 若劳动者因自身原因未提供劳动（如无故旷工），用人单位可依据规章制度和法律规定不支付旷工期间工资，但这与劳动仲裁本身并无直接关联。
   • 若劳动者违反了公司的规章制度，并且给公司造成了损失，公司可依据相关规定扣除部分工资，但扣除后劳动者所获得的工资不能低于当地的最低工资标准。

综上所述，公司在劳动仲裁期间停发工资是不符合法律规定的。劳动者可以采取上述应对办法来维护自己的合法权益。若你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。