职工起诉单位赔偿因档案丢失造成的损失，一般属于劳动争议案件。下面我从两个角度为您详细分析这一问题：
属于劳动争议的观点：
- 根据《劳动合同法》第五十条规定，用人单位应当在解除或者终止劳动合同时出具解除或者终止劳动合同的证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。因此，如果因用人单位迟延转移档案或者将员工档案丢失，劳动者要求用人单位赔偿损失的纠纷，应属于劳动纠纷。单位因管理不善导致员工档案丢失，给员工造成损失的，应当承担赔偿责任。
属于民事纠纷的观点：
- 根据《最高人民法院关于人事档案被原单位丢失后当事人起诉原用人单位补办人事档案并赔偿经济损失是否受理的复函》，保存档案的企事业单位如果违反关于妥善保存档案的法律规定，丢失他人档案的，应当承担相应的民事责任。档案关系人起诉请求补办档案、赔偿损失的，人民法院应当作为民事案件受理。因此，也有观点认为，因用人单位原因造成劳动者档案丢失，单位应依法承担相应的民事责任，属于一般的民事纠纷。
在司法实践中，关于此类纠纷的性质，各地法院可能会有不同的认定。但无论认定为哪种性质，劳动者因档案丢失遭受损失都是不争的事实，用人单位都应当承担相应的赔偿责任。只是赔偿的具体金额，需要司法实践结合个案的具体情况、劳资双方的过错程度、档案丢失给员工造成的损失大小等方面综合酌情确定。
如果您遇到了类似的情况，建议保存好相关证据，及时咨询专业律师，以便更好地维护自己的合法权益。如果您还有其他法律问题，欢迎随时向我咨询。