您好，关于一次性补发工资如何扣税的问题，这需要根据补发工资的具体性质来确定。以下是对不同情形下一次性补发工资扣税方式的详细解释：

1. 补发工资属于正常补发（如因特殊原因延迟发放）：

   • 处理方式：将补发工资与当月工资合并计税。
   • 法律依据：《个人所得税法》第六条。
   • 操作步骤：首先，将补发工资与当月工资合并，计算应发工资总额；然后，扣除五险一金等专项扣除及专项附加扣除；最后，根据剩余金额对照个人所得税税率表，计算应缴税额。

2. 补发工资属于补发以前月份工资（如企业资金困难导致延迟发放）：

   • 处理方式：原则上应分摊到所属月份计税，但实际操作中可能因各地税务政策差异而有所不同，建议咨询当地税务部门确认。
   • 法律依据：参考《关于对补发以往月份工资计算个人所得税问题的通知》（具体文件可能因地区而异）。
   • 操作步骤：首先，确定补发工资所属的月份及每月应发而未发的工资数额；然后，将每月应发而未发的工资与正常工资合并，计算应纳税所得额；接着，查找适用税率和速算扣除数，计算每月应缴税额；最后，汇总各月税额，得出补发工资应缴纳的个人所得税总额。

3. 补发工资属于一次性奖金性质（如年度绩效奖金等）：

   • 处理方式：可选择单独计税或并入综合所得计税。
   • 法律依据：《财政部 税务总局关于个人所得税法修改后有关优惠政策衔接问题的通知》（财税〔2018〕164号）。
   • 单独计税操作步骤：首先，将一次性奖金除以12，得到商数；然后，根据商数查找适用税率和速算扣除数；最后，计算应纳税额。
   • 并入综合所得计税操作步骤：首先，将一次性奖金与其他综合所得合并；然后，扣除费用六万元及相关扣除项目；最后，根据剩余金额对照税率表计算应缴税额。

4. 个人因解除劳动关系取得的一次性补偿收入：

   • 处理方式：部分免征，超额部分征税。
   • 具体规定：对于个人因解除劳动关系而取得的一次性补偿收入，在当地上年职工平均工资3倍数额以内的部分免征个人所得税；超过部分则需按规定计算征收。计算方法为将一次性补偿收入除以工作年限数（不超过12年），以其商数作为月工资薪金收入计算税额。工作年限不满一年的，按月换算成年份计算。

综上所述，一次性补发工资的扣税方式需根据具体情况和税收法规来确定。在实际操作中，建议您咨询当地税务部门或专业税务顾问以确保准确合规地处理税务问题。