针对“事业编三年后单位可以不续签吗”这一问题，首先我们要明确的是，事业单位与其工作人员之间的聘用关系通常是基于合同来确定的。在合同期满时，单位是否续签，需要遵循相关法律法规以及合同中的约定。

从一般原则来看，如果事业单位工作人员在聘期内表现合格，且没有违反相关法律法规或单位规章制度，那么单位在合同期满后应当考虑续签。然而，这并不是绝对的，因为单位还需要根据自身的实际情况、岗位需求、人员配置以及政策要求等多方面因素来综合考虑。

现在，我们结合提供的案例分析来进一步探讨这个问题。在案例中，孙某与单位签订了为期3年的二级岗聘期考核协议，并且在聘期内年度考核均为合格。然而，在聘期结束前，单位做出了不再续聘的决定。根据分析，这个决定被认为是不合理的，因为孙某并没有出现应当撤销二级岗位聘用资格的情形，如严重违反职业道德、年度考核不合格或连续2年考核为基本合格等。

由此，我们可以推断出，在事业编三年后，单位不可以随意不续签。如果单位想要不续签，必须基于合理的理由和依据，如工作人员表现不合格、违反单位规章制度或法律法规等。否则，单位的不续签决定可能会被视为不合理或违法。

综上所述，事业编三年后单位是否可以续签，需要根据具体情况来判断。如果工作人员表现合格且没有违反相关规定，单位应当考虑续签。如果单位想要不续签，必须提供合理的理由和依据。同时，我们也建议事业单位和工作人员在签订合同时，明确约定续签的条件和程序，以避免后续出现不必要的纠纷。