员工休息一天扣工资通常是不合法的。下面我来详细解释一下：

一、法律依据与通常不合法的原因

1. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》第五十一条，劳动者在法定休假日和婚丧假期间以及依法参加社会活动期间，用人单位应当依法支付工资。
   • 同时，《中华人民共和国劳动法》第九十一条规定，用人单位克扣或者无故拖欠劳动者工资的，将受到法律制裁。

2. 原因阐述：

   • 员工享有休息休假的权利，这是劳动法赋予的基本权益。
   • 在正常的休息日（如周末或法定节假日），员工有权享受带薪休假，用人单位不得无故扣减工资。

二、可能合法的特殊情况

尽管通常情况下休息日扣工资不合法，但也存在某些特殊情况下扣减工资可能具有合法性：

1. 员工请事假：

   • 若员工在休息日向公司请事假并获得批准，公司可以按照规章制度扣除事假期间的工资。
   • 这要求公司有明确的请假制度，并且该制度已向员工公示。

2. 与加班调休相关：

   • 如果员工之前在休息日加班，公司安排了调休但员工拒绝或不配合调休安排，公司可能根据明确的加班和调休制度进行适当工资调整。
   • 但这需要公司有明确的加班和调休规定，并已提前告知员工。

3. 经济赔偿：

   • 在某些特殊情况下，如员工违反企业管理制度并给企业造成经济损失，用人单位可以要求员工赔偿经济损失，并从其工资中扣除。
   • 但每月扣除的部分不得超过员工当月工资的20%，且扣除后的剩余工资部分不得低于当地月最低工资标准。

三、员工如何应对

如果员工认为公司在休息日扣工资的行为不合法，侵害了自身权益，可以采取以下措施来维护自己的合法权益：

1. 与公司沟通：首先与公司的人力资源部门或相关负责人进行沟通，了解扣工资的具体原因，并要求公司提供相应的依据。

2. 投诉举报：如果公司无法给出合理解释或拒绝纠正错误行为，员工可以向当地的劳动监察部门投诉举报，寻求政府部门的帮助。

3. 法律途径：如果投诉举报也无法解决问题，员工可以向劳动仲裁委员会申请仲裁。对仲裁结果不服的，还可以向人民法院提起诉讼。

综上所述，员工在休息日被扣工资通常是不合法的。员工应了解自己的权益，并在权益受损时及时采取措施维护自身合法权益。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。