新员工入职三天辞职，需要发工资。以下是具体的分析：

1. 法律依据：

   • 根据《劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
   • 《劳动合同法》第三十条也规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。
   • 《工资支付暂行规定》第九条明确指出，劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。

2. 具体情况分析：

   • 新员工入职三天并提供了正常劳动，那么无论其工作时间长短，只要付出了劳动，用人单位就应当按照劳动合同约定的标准或者同工同酬的原则，支付这三天的工资。
   • 如果用人单位以新员工工作时间短为由拒绝支付工资，这是不合法的。新员工有权要求用人单位支付其应得的工资，并可以通过协商、向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁等方式来维护自己的合法权益。

3. 实际操作建议：

   • 新员工在离职时，应当与用人单位协商处理好工资结算等相关事宜，确保自己的合法权益不受侵害。
   • 如果用人单位拒绝支付工资，新员工可以保存好相关证据（如劳动合同、工作记录、离职证明等），以便后续通过法律途径维权。

综上所述，新员工入职三天辞职后，用人单位应当支付其这三天的工资。如果遇到用人单位拒付工资的情况，新员工可以依法维权。