结论：员工旷工三天自动离职，用人单位仍需支付其应得的工资，但用人单位有权根据规章制度扣除相应的旷工罚款（如有），且若员工行为给用人单位造成损失，用人单位可依法追偿。
详细分析：
工资支付义务：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动者提供了正常劳动，用人单位应当按照劳动合同约定的工资标准支付工资。旷工三天并不意味着劳动者完全未提供劳动，只是未按照正常出勤时间提供劳动。因此，用人单位仍需支付劳动者在旷工期间之外应得的工资。
旷工罚款与规章制度：
- 用人单位通常会在规章制度中明确旷工的处理方式，包括旷工罚款等。如果规章制度中规定了旷工罚款，并且该规章制度已经依法告知劳动者，且内容合法合理，那么用人单位有权根据规章制度扣除劳动者相应的旷工罚款。但需要注意的是，旷工罚款的数额应当合理，不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的工资不得低于当地最低工资标准。
损失追偿权：
- 如果劳动者的旷工行为给用人单位造成了经济损失，用人单位有权依法要求劳动者进行赔偿。这种赔偿通常需要通过劳动争议仲裁或诉讼程序来解决，并且用人单位需要提供充分的证据证明损失的存在以及损失与劳动者旷工行为之间的因果关系。
自动离职的法律后果：
- 旷工三天并不直接导致劳动合同的自动解除。劳动合同的解除需要符合法律规定的条件和程序。如果用人单位希望解除与旷工劳动者的劳动合同，应当依法进行，如提前通知、支付经济补偿等（如果符合法定解除条件且无需支付经济补偿的情形除外）。自动离职并不免除用人单位支付工资的义务，也不影响用人单位依法追究劳动者责任的权利。
建议与行动：
- 对于用人单位：建议完善规章制度，明确旷工的处理方式和罚款标准，并确保这些规章制度已经依法告知劳动者。在处理旷工员工时，应当遵循法律规定的程序和条件，避免违法解除劳动合同或侵犯劳动者权益。
- 对于劳动者：如果因故无法出勤，应当提前向用人单位请假并说明原因。如果旷工行为已经发生，应当积极与用人单位沟通，了解旷工罚款和工资支付情况，并尽快补办请假手续或接受处理。如果认为用人单位的处理方式不合法或不合理，可以通过劳动争议仲裁或诉讼程序来维护自己的权益。
示例说明：
假设某员工月工资为5000元，旷工三天。根据用人单位的规章制度，旷工一天罚款200元。那么，该员工应得的工资为：5000元 - 3天 × 200元/天 = 4400元（假设没有其他扣除项）。如果该员工的旷工行为给用人单位造成了经济损失，并且用人单位能够提供充分证据证明这一点，那么用人单位可以在法律允许的范围内要求该员工进行赔偿。