当您的食品证（这里假设是食品经营许可证或食品生产许可证）过期三个月时，您需要尽快办理续期手续，以确保您的经营活动合法合规。以下是具体的办理流程和注意事项：

一、了解续期规定

首先，根据《食品生产许可管理办法》的相关规定，食品生产者需要在食品生产许可有效期届满30个工作日前向原发证的市场监督管理部门提出申请。虽然您已经超过了这个时限，但仍然需要尽快补办续期手续。

二、准备续期材料

为了顺利办理续期，您需要准备以下材料：

1. 食品生产许可延续申请书：这是必须的申请材料，表明您希望延续食品生产许可的意愿。
2. 与延续食品生产许可事项有关的其他材料：这可能包括您的营业执照、原食品生产许可证、食品安全管理制度、生产场所的环境卫生状况等材料。具体所需材料可能因地区而异，建议咨询当地市场监督管理部门。

三、在线或窗口提交申请

您可以选择通过当地市场监督管理部门的官方网站（如上海市的“一网通办”平台）或亲自前往窗口提交续期申请。以下是在线提交的步骤：

1. 访问当地市场监督管理部门的官方网站或指定平台。
2. 找到食品生产许可延续的申请入口，通常会有“我要申请”或类似的按钮。
3. 按照提示填写申请信息，上传准备好的申请材料。
4. 确认提交申请，并等待审核结果。

如果您选择窗口提交，则需携带所有准备好的材料前往当地市场监督管理部门的窗口进行办理。

四、等待审核与领证

提交申请后，您需要等待市场监督管理部门的审核。审核通过后，您会收到领证通知（可能是短信、邮件或电话通知）。收到通知后，请按照指示携带纸质材料到指定窗口领取延续后的食品生产许可证。

五、注意事项

1. 尽快办理：虽然您已经超过了规定的申请时限，但仍然需要尽快补办续期手续，以避免可能的法律风险和经营影响。
2. 咨询当地部门：由于不同地区的市场监督管理部门可能有不同的要求和流程，建议您在办理前咨询当地部门以获取最准确的信息。
3. 保持信息一致：在填写申请信息和准备材料时，请确保所有信息的一致性和准确性。

希望以上信息能够帮助您顺利办理食品证的续期手续。如果您有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时咨询当地市场监督管理部门。