法院庭长的回避由审判委员会决定。

在司法程序中，回避制度是一项重要的原则，旨在确保审判的公正性和中立性。当涉及法院庭长（若庭长同时担任审判长）的回避问题时，这一制度的实施尤为关键。

根据《中华人民共和国民事诉讼法》第四十九条以及《中华人民共和国刑事诉讼法》第三十一条的明确规定，院长（若庭长即为院长或担任审判长时）的回避，由本院审判委员会决定。审判委员会作为人民法院内部对审判工作实行集体领导的组织形式，能够确保回避决定的公正性和权威性。这是因为审判委员会作为一个集体决策机构，能够避免因个人利害关系而影响回避决定的公正性。

在实际操作中，如果认为法院庭长存在需要回避的情况，相关当事人或诉讼代理人可以向法院提出申请，并提供充分的证据和理由。随后，该申请将由审判委员会进行审查，并根据实际情况作出是否同意回避的决定。这一程序确保了回避制度的有效实施，同时也保障了当事人的合法权益。

综上所述，法院庭长的回避问题，在庭长同时担任审判长的情况下，应由本院的审判委员会来决定。这样的决定程序既符合法律法规的规定，又能够确保审判的公正性和法院的公信力。