公司缴纳社保与灵活就业缴纳社保之间确实存在一些区别，这些区别主要体现在缴费强制性、参保险种、缴费主体与比例以及可能享受的补贴上。下面我将为您详细解释这些差异：

1. 缴费强制性：

   • 公司缴纳：企业职工参保是强制性的，即只要您在公司工作，公司就必须为您缴纳社保。
   • 灵活就业：灵活就业人员可以自由选择是否参保，以及参保的险种和缴费档次。

2. 参保险种：

   • 公司缴纳：用人单位必须为员工参加养老保险、工伤保险、失业保险、医疗保险和生育保险（通常称为“五险一金”）。
   • 灵活就业：灵活就业人员可以自主选择参加养老保险、医疗保险，部分地方也允许灵活就业人员参加失业保险。但工伤保险和生育保险通常不包括在灵活就业人员的参保范围内。

3. 缴费主体与比例：

   • 公司缴纳：社保费用由公司和员工共同承担，具体比例根据地区政策有所不同，但通常公司承担大部分费用。
   • 灵活就业：缴费由个人全额承担。对于养老保险，灵活就业人员可以在本省全口径城镇单位就业人员平均工资的60%-300%之间选择适当的缴费基数，缴费比例为20%。医疗保险和失业保险的缴费比例和基数也根据地区政策有所不同。

4. 可能享受的补贴：

   • 灵活就业：部分地方对就业困难人员、离校2年内未就业的高校毕业生等灵活就业人员提供社保补贴，具体标准按灵活就业后缴纳的社会保险费给予一定数额的补贴，原则上不超过实际缴费的2/3。这种补贴在公司缴纳社保的情况下通常是不适用的。

尽管存在上述差异，但无论是灵活就业人员还是单位职工参保，养老金待遇的计发办法都是一样的。即，在缴费基数、缴费年限等因素相同的情况下，灵活就业人员享受的待遇与单位职工是一样的，待遇水平并不会打折扣。

综上所述，公司缴纳社保与灵活就业缴纳社保在多个方面存在差异，但两者在养老金待遇的计发上是一致的。选择哪种参保方式取决于您的个人情况和职业规划。