灵活就业社保和企业交社保之间确实存在一些显著的差异，这些差异主要体现在缴纳的险种、费用的承担主体以及养老保险费计入统筹账户的比例上。下面我将为您详细解释这些区别：

1. 缴纳的险种数量不同：

   • 灵活就业人员社保只能缴纳“两险”，即养老保险和医疗保险。
   • 企业员工社保则需要缴纳“五险”，包括养老保险、失业保险、工伤保险、医疗保险和生育保险。这意味着企业员工在社保保障上更为全面。

2. 社保费用的承担主体不同：

   • 灵活就业人员社保费用全部由个人承担，没有单位分担。
   • 企业员工社保费用则由单位和个人根据规定的比例共同承担，具体比例可能因地区和政策而异，但通常企业会承担较大比例的费用。

3. 养老保险费计入统筹账户部分比例不同：

   • 灵活就业人员养老保险计入统筹账户部分为缴费基数的12%。
   • 企业员工养老保险计入统筹账户部分为缴费基数的16%。
   • 两者养老保险费计入个人账户部分都是缴费基数的8%，这部分将用于计算个人退休待遇。而计入统筹账户的部分，虽然不直接计算到个人退休待遇内，但它是构成社会养老保险制度的重要部分，用于支付基础养老金等社会统筹待遇。

尽管存在上述差异，但如果灵活就业人员和企业员工的出生年月、参保地、参保时间、缴费基数、退休时间等情况完全一致，并且都按照规定的比例和基数缴纳了养老保险费，那么他们的退休待遇在理论上是一样的。这是因为退休待遇的计算主要基于个人账户的储存额和缴费年限等因素，而这些因素在两种情况下是可以相同的。

总的来说，灵活就业社保和企业交社保在缴纳的险种、费用的承担主体以及养老保险费计入统筹账户的比例上存在差异，但这些差异并不影响两者在退休待遇上的平等性（在相同条件下）。选择哪种社保方式主要取决于个人的职业状态、经济能力和对未来生活的规划。