子公司清算，劳动合同关系转入另一子公司，经济补偿金并非一定拿不到。这个过程在法律上视为原劳动合同的解除和新劳动合同的订立，具体是否能拿到经济补偿金，要根据实际情况来判断。
若员工主动提出转入：
- 在这种情况下，通常视为员工主动离职，因此原子公司一般不需要支付经济补偿金。
若因原子公司经营原因转入：
- 若因原子公司经营不善、解散、清算等原因导致员工被安排到另一子公司，且原子公司未支付经济补偿金的，根据《劳动合同法》第四十六条的规定，原子公司或新子公司（根据约定）应当支付经济补偿金。经济补偿金的具体数额根据员工在原子公司的工作年限和月工资来计算。
工龄计算与经济补偿金：
- 根据《最高人民法院关于审理劳动争议案件适用法律问题的解释（一）》第四十六条，如果员工在非个人原因下被安排到新用人单位工作，且原用人单位未支付经济补偿时，工作年限应合并计算为新用人单位的工作年限。这意味着，在计算经济补偿金时，可能会考虑到员工在原子公司和新子公司的总工作年限。
注意事项：
- 在整个过程中，要确保转出子公司和转入子公司与员工进行充分沟通，明确调动原因、新岗位内容、工作地点、薪资待遇等，并取得员工的书面同意。
- 转出子公司需在解除合同时出具证明，并在十五日内办理档案和社会保险关系转移手续。
- 新合同应明确工作内容、地点、时间、劳动报酬、社会保险等条款，且不得低于原合同条件。
综上所述，子公司清算后劳动合同关系转入另一子公司，经济补偿金的支付情况取决于多种因素。如果你在这方面有具体的法律问题或疑虑，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议和指导。