结论：劳务公司扣安全基金是否合法，需根据具体情况判断，主要看该扣除行为是否有合法依据以及是否符合相关法律规定。以下从不同角度进行分析：
合法扣除的情况
- 有合法约定且符合规定：如果劳务公司与劳动者在劳动合同或者相关规章制度中明确约定了安全基金的扣除事项，并且该约定不违反法律法规的强制性规定，比如扣除比例合理、扣除目的合法（如用于保障工作场所安全设施的维护、员工安全培训等），那么劳务公司扣除安全基金可能是合法的。例如，双方约定每月从劳动者工资中扣除一定比例（该比例需在合理范围内，一般不超过工资的20%，且扣除后剩余工资不低于当地最低工资标准）作为安全基金，用于改善工作环境安全条件，这种情况下扣除行为具有合法性。
- 法定扣除情形：在某些特殊情况下，如果法律法规明确规定可以扣除相关费用用于安全方面，劳务公司按照规定进行扣除也是合法的。不过目前并没有普遍适用于所有劳务关系的、直接规定可以扣除安全基金的法律法规，但在一些特定行业或特定工作场景下，可能有相关的行业规定或地方性法规允许在符合条件下进行扣除。
非法扣除的情况
- 无合法依据扣除：如果劳务公司与劳动者没有就安全基金的扣除达成任何合法有效的约定，也没有法律法规的明确授权，那么劳务公司擅自扣除安全基金就是非法的。例如，劳务公司突然通知从劳动者工资中扣除一笔钱作为安全基金，但之前从未提及此事，也没有相关的制度规定，这种扣除行为侵犯了劳动者的合法权益。
- 扣除比例过高或违反最低工资标准：即使有扣除安全基金的约定，但如果扣除比例过高，导致劳动者实际到手工资低于当地最低工资标准，那么这种扣除行为也是违法的。根据法律规定，用人单位支付给劳动者的工资不得低于当地最低工资标准，扣除费用后仍需保障这一基本要求。
- 扣除目的不合法：如果劳务公司扣除安全基金并非用于合法的安全相关事项，而是挪作他用，比如用于公司高层的个人消费、投资等，那么这种扣除行为显然是非法的，劳动者有权要求劳务公司返还被扣除的款项，并可以向劳动监察部门投诉。
法律建议：
- 如果劳动者遇到劳务公司扣除安全基金的情况，首先应查看自己与劳务公司签订的劳动合同以及公司的相关规章制度，看是否有关于安全基金扣除的约定以及约定的具体内容。
- 如果发现扣除行为可能存在违法情况，劳动者可以与劳务公司进行沟通协商，要求其说明扣除的依据和用途，并要求返还非法扣除的款项。
- 若协商无果，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉，由劳动监察部门对劳务公司的扣除行为进行调查处理；也可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，通过法律途径维护自己的合法权益。
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