结论：员工长时间请假后，公司调岗是否合法，需根据具体情况判断，主要包括请假原因、调岗合理性、劳动合同约定以及公司规章制度等因素。

1. 请假原因与调岗合法性

   • 若员工因病或非因工负伤长时间请假，且在医疗期满后不能从事原工作，公司有权根据《劳动合同法》第四十条的规定，与员工协商调岗。若员工拒绝调岗，公司可提前三十日以书面形式通知员工或额外支付一个月工资后解除劳动合同，但需支付经济补偿。
   • 若员工因其他原因（如事假、年假等）长时间请假，且请假期间并未影响其履行原岗位职责的能力，公司单方面调岗可能缺乏合法性依据，除非劳动合同或公司规章制度中有明确规定。

2. 调岗的合理性

   • 调岗应具有合理性，即新岗位应与员工原岗位的工作内容、技能要求、薪酬待遇等相当或相近。若公司调岗至与员工原岗位完全不相关的岗位，且未与员工协商一致，可能构成违法调岗。
   • 调岗还应考虑员工的身体状况、技能水平、职业发展规划等因素，确保调岗不会对员工造成不合理的负担或损害其合法权益。

3. 劳动合同与规章制度

   • 若劳动合同中明确约定了公司有权在特定情况下调岗，且该约定不违反法律法规的强制性规定，公司调岗可能具有合法性。
   • 若公司规章制度中规定了调岗的条件、程序等，且该规章制度已经过民主程序制定并公示或告知员工，公司调岗也可能具有合法性。但需注意，规章制度中的调岗规定应合理合法，不得侵犯员工的合法权益。

4. 实际操作建议

   • 对于公司而言，在调岗前应与员工进行充分沟通，说明调岗的原因、目的、新岗位的工作内容、薪酬待遇等，并尽量取得员工的同意。若员工拒绝调岗，公司应谨慎处理，避免直接单方面调岗引发劳动纠纷。
   • 对于员工而言，若公司提出调岗要求，应仔细了解调岗的原因、新岗位的情况等，并结合自身实际情况做出判断。若认为调岗不合理或侵犯了自己的合法权益，可以与公司进行协商或向劳动仲裁机构申请仲裁。

可能后果：若公司违法调岗，员工有权要求公司恢复原岗位或支付相应的赔偿。同时，公司还可能面临劳动行政部门的处罚或劳动仲裁机构的裁决。因此，公司在调岗时应严格遵守法律法规和劳动合同约定，确保调岗的合法性和合理性。

进一步思考：在实际操作中，调岗问题往往涉及复杂的法律关系和事实认定。因此，若遇到具体调岗纠纷，建议及时咨询专业律师以获取更具体的法律建议。你可以直接向我咨询，我会结合你的具体情况为你提供详细的法律分析和建议。