针对您提出的“楼顶种菜物业怎么处理”的问题，这是一个涉及小区公共区域管理和业主权益的复杂情况。以下是我为您提供的详细解答：
一、物业的基本职责与初步行动
物业作为小区的管理者，有责任维护小区公共区域的正常使用秩序和环境卫生。楼顶作为小区公共区域的一部分，其使用和管理应遵循物业管理合同和相关规定。当发现楼顶有业主种菜时，物业应首先采取以下行动：
与涉事业主沟通：物业应主动与占用公共区域种菜的业主进行沟通，了解其种菜的原因和意图，同时明确告知其行为违反了物业管理规定，侵犯了其他业主的合法权益。
发出整改通知：若沟通无果，物业应依据物业管理合同和相关规定，向涉事业主发出正式的整改通知，要求其在规定期限内停止种菜行为，并恢复楼顶原状。
二、物业可采取的进一步措施
如果涉事业主未按照整改通知的要求进行整改，物业可以采取以下进一步措施：
联合其他业主共同协商：物业可以组织受影响的其他业主一起与涉事业主进行协商，形成集体力量，增加协商解决的可能性。
请求第三方调解：物业可以向社区居委会或相关调解机构请求介入调解，通过第三方中立的角度来促使双方达成和解。
向相关部门投诉：若上述方式均无法解决问题，物业可以向城市管理综合行政执法部门（城管部门）、房屋管理部门（住建局相关科室）等投诉，请求其依法查处楼顶种菜行为。
三、物业在处理过程中的注意事项
保持冷静和理性：物业在处理此类问题时，应保持冷静和理性，避免采取过激行为或言语攻击，以免激化矛盾。
收集并保留好相关证据：物业应注意收集并保留好楼顶种菜的照片、视频等证据，以及与涉事业主沟通的记录等，以便在需要时有力地证明自己的主张。
咨询专业律师：如果问题复杂或涉及法律纠纷，物业可以咨询专业律师，了解自己的法律权利和可行的法律方案，确保自身权益得到充分保护。
四、业主的配合与支持
作为小区的业主，您也有责任和义务维护小区的公共利益和秩序。在物业处理楼顶种菜问题的过程中，您可以：
积极配合物业的工作：如提供线索、协助沟通等，共同推动问题的解决。
理性表达诉求：在与其他业主或物业沟通时，保持理性态度，避免情绪化表达，以促进问题的和平解决。
综上所述，物业在处理楼顶种菜问题时，应综合运用沟通协商、第三方调解、投诉举报等多种手段，同时业主也应积极配合和支持物业的工作，共同维护小区的公共利益和秩序。