政府部门周末加班一般是有加班工资的，但具体是否发放及发放标准需根据实际情况判断。以下从不同角度为你详细分析：
一、法律法规依据
根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条的规定，有下列情形之一的，用人单位应当按照下列标准支付高于劳动者正常工作时间工资的工资报酬：
- 安排劳动者延长工作时间的，支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；
- 休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；
- 法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。
政府部门作为用人单位，同样需要遵守这一规定。因此，如果政府部门在周末（即休息日）安排员工加班，且不能安排补休的，应当支付不低于工资的百分之二百的加班工资。
二、特殊情况说明
值班与加班的区别：
- 值班通常指员工在非工作时间段内，为了维护单位正常秩序、保障安全等目的而进行的临时性工作。值班期间员工可能并不一直处于工作状态，且值班任务相对较轻。
- 加班则是指员工在正常工作时间之外，继续从事本职工作或单位安排的其他工作。加班期间员工需要全身心投入工作，且加班任务通常较重。
- 如果政府部门安排的是值班而非加班，且值班任务不重，可能不会按照加班工资的标准支付报酬。但具体是否支付及支付标准，还需根据单位内部规定和实际情况判断。
单位内部规定：
- 政府部门可能根据自身工作特点和实际情况，制定了内部关于加班和值班的规定。这些规定可能涉及加班工资的支付标准、支付方式、支付时间等。
- 如果单位内部规定与法律法规相冲突，应以法律法规为准。但如果单位内部规定更加优厚于员工，如提高了加班工资的支付标准，则应按照单位内部规定执行。
三、实际操作建议
了解单位规定：
- 作为政府部门员工，应首先了解单位内部关于加班和值班的规定，明确自己的权益和义务。
保留证据：
- 如果政府部门安排了周末加班，且未支付加班工资或未安排补休，员工应保留好相关证据，如加班通知、工作记录等，以便在需要时维护自己的合法权益。
协商与投诉：
- 如果员工认为自己的加班工资未得到合理支付，可以先与单位进行协商，寻求解决方案。
- 如果协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
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