公司留存员工工伤证原件，主要是基于以下几个方面的考虑：

一、作为工伤认定的法定证明

工伤证是员工经过社会保险行政部门工伤认定后获得的法定证明文件，它证明了员工所受伤害属于工伤范畴。公司留存工伤证原件，可以确保在需要时能够迅速提供这一关键证据，以支持员工的工伤待遇申请或处理相关纠纷。

二、便于申请工伤保险待遇

在员工被认定为工伤后，公司需要持工伤证原件等相关材料向社会保险经办机构申请工伤保险待遇报销。这包括工伤医疗费用、一次性伤残补助金以及一次性工伤医疗补助金等。留存工伤证原件可以确保公司在申请这些待遇时能够顺利提交所需材料，从而保障员工的合法权益。

三、作为员工工伤情况的记录

工伤证原件也是公司记录员工工伤情况的重要依据。通过留存工伤证，公司可以清晰地了解员工的工伤历史、伤残等级以及享受过的工伤保险待遇等信息。这对于公司制定员工健康管理计划、调整工作岗位或安排复职等决策具有重要参考价值。

四、应对可能的法律纠纷

在工伤事故处理过程中，有时可能会涉及法律纠纷或诉讼。公司留存工伤证原件，可以在必要时作为法律证据，以证明员工的工伤事实和公司的处理情况。这有助于公司在法律纠纷中维护自身权益，避免不必要的法律风险。

五、符合相关法规要求

根据《工伤保险条例》等相关法规的规定，用人单位在工伤事故处理过程中需要承担一定的责任和义务。留存工伤证原件是公司履行这些责任和义务的一部分，也是符合法规要求的做法。

总结与建议：

公司留存员工工伤证原件是出于多方面的考虑，包括作为工伤认定的法定证明、便于申请工伤保险待遇、记录员工工伤情况、应对可能的法律纠纷以及符合相关法规要求等。因此，建议您理解并配合公司的这一做法。同时，如果您对工伤证原件的留存有任何疑问或担忧，可以与公司的人力资源部门或相关负责人进行沟通，以获取更详细的解释和说明。