员工因自身疾病死亡，用人单位的赔偿责任需根据具体情况综合判断，主要取决于疾病是否与工作有关、是否构成工伤以及用人单位是否为员工缴纳了相关社会保险等因素。以下是对此问题的详细分析：
一、工伤情形下的赔偿责任
视同工伤的情况：
- 根据《工伤保险条例》第十五条第一款第（一）项规定，如果员工在工作时间和工作岗位突发疾病死亡，或者在48小时之内经抢救无效死亡，这将被视同工伤。
- 赔偿项目：包括丧葬补助金（6个月的统筹地区上年度职工月平均工资）、一次性工亡补助金（上一年度全国城镇居民人均可支配收入的20倍）以及供养亲属抚恤金（按照职工本人工资的一定比例发放给由因工死亡职工生前提供主要生活来源、无劳动能力的亲属）。
疾病与工作直接相关：
- 如员工因接触有毒有害物质等职业因素导致疾病并最终死亡，用人单位可能需根据相关法律法规承担赔偿责任，具体标准和责任需依据实际情况判断。
二、非工伤情形下的赔偿责任
疾病与工作无关：
- 通常情况下，如果员工疾病与工作无关且不属于工伤范畴，用人单位在法律上没有必须进行赔偿的义务。
- 人道主义考虑：但出于人道主义考虑，部分用人单位可能会提供一定的经济援助或补偿，如支付丧葬补助费、一次性救济金等，这通常基于地方规定或单位规章制度。
社会保险缴纳情况：
- 已缴纳社保：如果用人单位已为员工缴纳基本养老保险等社会保险，员工因病或非因工死亡后，其遗属可以依法从社会保险基金领取丧葬补助金、抚恤金等费用，用人单位不承担直接赔偿责任。
- 未缴纳社保：若用人单位未依法为员工缴纳社会保险，导致员工家属无法享受相应的社会保险待遇，用人单位可能需要在应享受的保险待遇范围内承担赔偿责任，并可能面临其他法律责任。
三、特殊情况考量
- 劳务关系中的疾病死亡：在劳务关系中，若提供劳务者因疾病死亡，其赔偿责任的判定需综合考虑多种因素。通常情况下，接受劳务一方对提供劳务者因自身疾病导致的死亡不承担赔偿责任，但如果接受劳务一方对提供劳务者疾病的发生、发展存在过错，或者提供劳务者在为接受劳务一方提供劳务过程中因工作原因导致原有疾病急性发作并最终死亡，接受劳务一方可能需要基于公平原则或过错分担一定的民事赔偿责任。
四、法律建议
- 及时沟通协商：建议用人单位在员工因病死亡后，积极与员工家属沟通协商，了解家属的诉求和困难，尽量达成和解协议，以妥善处理相关事宜。
- 咨询专业律师：在处理此类复杂问题时，用人单位应咨询专业律师的意见，以确保自身权益得到充分保障，并避免因处理不当而引发法律纠纷。
- 加强社会保险缴纳：用人单位应加强社会保险缴纳意识，确保员工权益得到充分保障。这不仅可以减轻用人单位在员工因病或非因工死亡后的赔偿责任，还可以提高员工的归属感和满意度。
总结来说，员工因自身疾病死亡时，用人单位的赔偿责任并非一成不变，而是需根据多种因素综合判断。在实际操作中，建议用人单位积极与员工家属沟通协商，并咨询专业律师的意见以妥善处理相关事宜。如果你有进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，可以直接向我咨询。