五险费用全部从工资里扣是违法的，这侵害了劳动者的合法权益。
法律依据与社保费用承担主体：
根据《中华人民共和国社会保险法》的相关规定，社会保险包括基本养老保险、基本医疗保险、工伤保险、失业保险和生育保险。对于这五项保险，法律明确了缴纳主体和比例，具体如下：
养老保险：由用人单位和职工共同缴纳，单位缴费比例通常约为工资总额的16%，个人缴费比例为本人工资的8%。
医疗保险：同样由用人单位和职工共同缴纳，单位缴费比例一般在6% - 10%之间，个人缴费比例为2%左右。
失业保险：也是由用人单位和职工共同缴纳，单位缴费比例和个人缴费比例合计通常不超过3%，常见的是单位缴纳2%，个人缴纳1%。
工伤保险：完全由用人单位缴纳，职工不承担任何费用。单位缴费比例根据行业风险程度不同有所差异，一般在0.2% - 1.9%之间。
生育保险：同样由用人单位缴纳，职工不承担费用。多数地区缴费比例为单位工资总额的0.5% - 1%。
单位违规的后果及劳动者权益保护：
如果用人单位将五险费用全部从个人工资中扣除，这明显违反了上述法律规定，属于未依法履行缴纳社会保险费义务的违法行为。对此，劳动者有权要求用人单位立即改正，并按照法律规定承担单位应缴纳的部分。
如果用人单位拒不改正，劳动者可以采取以下措施来维护自己的权益：
协商：首先尝试与用人单位进行友好协商，明确表达自己的诉求和法律依据，要求用人单位按照法律规定承担社保费用。
投诉：如果协商无果，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉举报。劳动监察部门有权责令用人单位限期改正，并补缴应当由单位承担的社保费用。
申请劳动仲裁：劳动者还可以依法向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求用人单位退还多扣除的费用，并赔偿因此造成的相应损失。
咨询专业律师：在维权过程中，如果劳动者感到困惑或需要更具体的法律帮助，可以咨询专业的律师或法律机构，以确保自己的权益得到充分保障。
特别提醒：
即使员工同意全部承担五险一金费用，并以书面形式放弃相关权利，这种约定也是无效的。因为为员工缴纳五险一金是企业的法定义务，不能通过任何形式予以免除或转嫁。因此，劳动者应时刻关注自己的社保缴纳情况，确保自身权益不受侵害。