员工生病不能继续工作，公司是否赔偿需根据具体情况判断，主要分为工伤和非工伤两种情况。以下是对此问题的详细分析：
一、工伤情况
如果员工生病是由于工作原因导致的，且被认定为工伤，那么公司需按照《工伤保险条例》及相关规定进行补偿。具体包括：
- 医疗费用：治疗工伤所需费用，符合工伤保险诊疗项目目录、工伤保险药品目录、工伤保险住院服务标准的，从工伤保险基金支付。若公司未依法缴纳工伤保险费，这些费用由公司承担。
- 停工留薪期工资：员工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。停工留薪期一般不超过12个月，伤情严重或情况特殊可适当延长，但延长不得超过12个月。
- 伤残津贴及补助金：工伤员工评定伤残等级后，可享受相应的伤残津贴和一次性伤残补助金，具体标准依据伤残等级确定。
- 生活护理费：对于生活不能自理的工伤员工，在停工留薪期需要护理的，由所在单位负责；已评定伤残等级并确认需要生活护理的，从工伤保险基金按月支付生活护理费。
二、非工伤情况
如果员工的疾病与工作无关，属于普通疾病，公司通常没有法定的补偿义务，但仍需遵循以下规定：
医疗期与病假工资：
- 员工享有医疗期，医疗期的时长根据员工实际工作年限和本单位工作年限确定，如实际工作年限10年以下，本单位工作年限5年以下的为3个月，5年以上的为6个月。
- 在医疗期内，公司应按照劳动合同的约定支付病假工资或疾病救济费，该费用可以低于当地最低工资标准支付，但不能低于最低工资标准的80%（部分地方规定为60%，具体以当地政策为准）。
解除劳动合同补偿：
- 医疗期满后，如果员工不能从事原工作，也不能从事由公司另行安排的工作，公司可以提前三十日以书面形式通知员工或额外支付一个月工资后，解除劳动合同。
- 此时，公司需按员工在本单位工作的年限支付经济补偿，每满一年支付一个月工资，六个月以上不满一年的按一年计算，不满六个月的支付半个月工资。经济补偿的月工资标准为员工劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。若员工月工资高于当地职工月平均工资三倍的，经济补偿标准按职工月平均工资三倍的数额支付，最高不超过十二年。
三、特殊情况
- 劳动合同约定：如果公司与员工签订的劳动合同中有关于患病期间的福利条款，如额外的病假工资、补贴等，公司应严格按照合同约定履行。
- 违法解除的后果：若公司未依法操作，如未进行调岗或培训即解除劳动合同，或在医疗期内违法解除，属于违法解除。员工可以要求公司继续履行劳动合同；若不要求继续履行或劳动合同已无法继续履行，公司需按经济补偿标准的二倍支付赔偿金。
举例说明：
- 假设员工A因工作原因受伤，被认定为工伤，那么公司需承担其医疗费用、停工留薪期工资等费用。
- 假设员工B因普通疾病需要休息治疗，且医疗期为3个月，那么在医疗期内，公司应支付其病假工资，且不得低于当地最低工资标准的80%。医疗期满后，如果B不能从事原工作，也不能从事公司另行安排的工作，公司可以解除劳动合同，但需支付经济补偿。
建议：
- 员工在生病期间应保留好相关医疗证明和费用单据，以便在需要时向公司或社保部门申请补偿。
- 公司在处理员工生病不能继续工作的问题时，应严格遵守相关法律法规，确保员工的合法权益得到保障。同时，也可以考虑为员工提供必要的帮助和支持，如调整工作岗位、提供心理辅导等。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。