关于健康证没有被查到是公司的问题还是员工的问题，这不能一概而论，需要分情况讨论：
如果公司有明确要求员工办理健康证，并且提供了办理健康证的相关指导或协助，但员工未按照要求办理或未将健康证提交给公司查验：
- 在这种情况下，责任主要在于员工。员工有义务遵守公司的规章制度，包括按照要求办理并提交健康证。如果员工未履行这一义务，导致健康证没有被查到，那么员工应当承担相应的责任。
如果公司未明确要求员工办理健康证，或者虽然要求了但未提供必要的指导或协助，导致员工不知道如何办理或无法及时办理：
- 在这种情况下，责任可能在于公司。公司作为管理者，有责任确保员工了解并遵守相关的法律法规和公司规章制度。如果公司未尽到这一责任，导致员工未能办理或提交健康证，那么公司应当承担相应的责任。
另外，还需要考虑健康证办理和查验的具体流程：
- 如果健康证是由公司统一组织办理并查验的，那么公司应当确保流程的顺畅和有效。如果因为公司流程上的问题导致健康证没有被查到，比如未及时通知员工办理、未妥善保管健康证等，那么责任在于公司。
- 如果健康证是由员工自行办理并提交给公司的，那么员工应当确保健康证的真实性和有效性，并按照公司要求及时提交。如果因为员工个人原因导致健康证没有被查到，比如未按时办理、提交了无效的健康证等，那么责任在于员工。
法律背景与建议：
- 根据相关法律法规，某些特定行业的员工需要办理健康证，这是为了保障公共卫生和消费者权益。因此，无论是公司还是员工，都应当重视健康证的办理和查验工作。
- 对于公司而言，应当明确要求员工办理健康证，并提供必要的指导和协助。同时，公司应当建立完善的健康证查验制度，确保员工的健康证真实有效。
- 对于员工而言，应当遵守公司的规章制度，按照要求办理并提交健康证。如果遇到问题或困难，应当及时与公司沟通并寻求帮助。
可能的法律后果：
- 如果因为健康证问题导致公共卫生事件或消费者权益受损，那么相关责任方（可能是公司或员工）可能需要承担相应的法律责任，包括民事赔偿、行政处罚等。
总结与进一步思考：
- 健康证没有被查到的问题涉及公司和员工双方的义务和责任。在具体情况下，需要根据双方的实际情况和具体流程来判断责任归属。
- 为了避免类似问题的发生，公司应当加强健康证办理和查验的管理工作，员工也应当积极配合并履行自己的义务。
如果您在健康证办理或查验过程中遇到任何问题或困惑，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。