结论：公司按每天100元发放工伤停工留薪期工资的做法，在大多数情况下是不合理的，因为这很可能低于您原本的工资水平。

分析：

1. 停工留薪期工资的定义与标准：

   • 根据《工伤保险条例》的规定，职工在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。这里的“原工资福利待遇”通常指的是职工在受伤前12个月的平均工资。

2. 您的情况分析：

   • 您提到原本的工资是5500元/月，而公司现在按每天100元发放。我们可以简单计算一下，如果按每月30天计算（实际可能因月份不同而有所差异，但此处为简化计算），每天100元则每月为3000元，这明显低于您原本的5500元/月工资。

3. 公司的做法是否合理：

   • 除非有特殊情况（如您与公司有特别约定，或者您的工资构成中包含大量非固定性奖金、津贴等，且这些部分在停工留薪期内不发放），否则公司按每天100元发放停工留薪期工资的做法是不合理的。因为这违反了《工伤保险条例》中关于“原工资福利待遇不变”的规定。

4. 您的权益与应对措施：

   • 您有权要求公司按照您原本的工资水平（即5500元/月）发放停工留薪期工资。
   • 如果公司拒绝，您可以先与公司进行协商，尝试达成和解。
   • 如果协商无果，您可以向当地的劳动保障监察部门投诉，或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。

建议：

• 在与公司沟通或采取法律行动前，建议您先收集好相关证据，如工资条、劳动合同、工伤认定书等，以证明您的工资水平和工伤事实。
• 如果您对法律程序不熟悉或担心自己处理不好，可以寻求专业律师的帮助，以确保您的权益得到充分保障。

公式计算（虽不直接涉及复杂公式，但为说明工资差异，可简单计算）：

• 原本月工资：5500元
• 公司现发放月工资（按每天100元，每月30天计）：3000元
• 工资差异：5500元 - 3000元 = 2500元/月

由此可见，公司现发放的工资与您原本的工资存在显著差异，因此公司的做法在大多数情况下是不合理的。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。