《食品安全法》第一百三十六条中规定的没收不合格食品，通常算作一次处罚。以下是对此问题的详细分析：
法律条款解读
《食品安全法》第一百三十六条规定，食品经营者履行了本法规定的进货查验等义务，有充分证据证明其不知道所采购的食品不符合食品安全标准，并能如实说明其进货来源的，可以免予处罚，但应当依法没收其不符合食品安全标准的食品；造成人身、财产或者其他损害的，依法承担赔偿责任。这里的“没收不合格食品”是法律明确规定的一种处罚措施，它通常与罚款、警告等其他处罚措施并列，作为对违法行为的制裁手段之一。
没收不合格食品的性质
没收不合格食品属于行政处罚的一种，其目的在于剥夺违法者因违法行为所获得的非法利益，防止其继续危害社会。在食品安全领域，没收不合格食品能够直接消除食品安全隐患，保护消费者的健康和安全。因此，从性质上看，没收不合格食品是一次独立的处罚行为。
处罚的独立性与关联性
独立性：没收不合格食品作为一次处罚，具有其独立的法律效果和程序要求。它不需要与其他处罚措施（如罚款）同时适用，也可以单独适用。只要食品经营者存在违法行为，且符合没收不合格食品的条件，监管部门就可以依法进行没收。
关联性：虽然没收不合格食品是一次独立的处罚，但在实际执法过程中，它可能与其他处罚措施（如罚款、警告等）同时适用。这取决于违法行为的性质、情节以及造成的后果等因素。例如，如果食品经营者的违法行为情节严重，造成了较大的社会影响或危害后果，那么监管部门除了没收不合格食品外，还可能对其处以罚款或警告等处罚。
实际应用中的注意事项
在实际应用中，监管部门在决定是否没收不合格食品以及是否同时适用其他处罚措施时，会综合考虑多种因素，包括违法行为的性质、情节、造成的后果以及食品经营者的主观过错程度等。因此，对于同一违法行为，不同监管部门或不同时间点的处罚决定可能存在差异。
建议：如果您作为食品经营者面临此类问题，建议积极配合监管部门的调查和处理工作，如实说明进货来源和情况，并主动采取措施消除食品安全隐患。同时，您也可以咨询专业律师（如我，褚培艺律师，专注于保险理赔、劳动纠纷、婚姻家庭、经济纠纷领域），以了解您的法律权益和义务，并寻求合法的解决方案。