公务员入职多年后被举报体检作假，处理方式需结合具体情节、证据及法律规定综合判断，可能涉及行政处分、职务调整甚至法律责任追究，具体分情况说明如下：

1. 若举报属实，且体检作假直接影响录用资格

根据《公务员法》第二十六条，“曾因犯罪受过刑事处罚的、被开除中国共产党党籍的、被开除公职的、被依法列为失信联合惩戒对象的，以及其他不符合录用条件的，不得录用为公务员”。体检作假属于“不符合录用条件”的情形，即使入职多年，若能证明其当时通过虚假体检骗取录用资格，单位可依据《公务员法》第八十八条、第八十九条，撤销录用决定，并可能追缴已发放的工资、福利等；若涉及伪造国家机关公文、证件（如虚假体检报告），还可能触犯《刑法》第二百八十条，构成“伪造国家机关公文、证件罪”，需承担刑事责任。

关键点：需有充分证据证明“作假行为”与“录用结果”的直接因果关系（如原始体检报告、证人证言等），且单位需在知道或应当知道该情形后及时处理（通常无追溯时效限制，但实践中需考虑合理性）。

2. 若举报属实，但体检作假未影响录用资格（如岗位无特殊健康要求）

若公务员所任职务对健康状况无特殊要求（如普通行政岗），且其入职后工作表现符合岗位要求，单位可能不会直接撤销录用，但仍可能依据《公务员法》第五十九条（“公务员应当遵纪守法，不得有弄虚作假等行为”）、《行政机关公务员处分条例》第二十二条（“弄虚作假，误导、欺骗领导和公众，造成不良后果的，给予警告、记过或者记大过处分；情节较重的，给予降级或者撤职处分；情节严重的，给予开除处分”），给予警告、记过、降级等行政处分，具体处分程度需结合作假情节、社会影响等因素综合判断。

关键点：此时处理重点在于“行为性质”（是否违反公务员职业道德），而非“录用资格”，因此处分相对较轻，但会留存档案，影响晋升、评优等。

3. 若举报不实，或证据不足无法认定作假

根据《公务员法》第五十七条，“公务员对涉及本人的处分等人事处理不服的，可以自知道该人事处理之日起三十日内向原处理机关申请复核；对复核结果不服的，可以自接到复核决定之日起十五日内，按照规定向同级公务员主管部门或者作出该人事处理的机关的上一级机关提出申诉”。若被举报人能提供反证（如真实体检报告、医院出具的证明等），证明举报内容不实，单位应终止调查，并可能依据《公务员法》第一百零三条（“机关因错误的具体人事处理对公务员造成名誉损害的，应当赔礼道歉、恢复名誉、消除影响；造成经济损失的，应当依法给予赔偿”），对被举报人进行名誉恢复或经济补偿。

关键点：被举报人需主动收集证据（如联系原体检医院调取档案、申请司法鉴定等），并通过单位内部申诉或行政复议、诉讼等途径维护权益。

4. 特殊情形：举报涉及历史问题（如入职时体检标准与现行不同）

若体检作假发生在多年前，且当时体检标准与现行标准存在差异（如某些疾病当时未被列为限制录用情形），需结合“法不溯及既往”原则判断。若作假行为在当时即违反录用规定，仍可能被追责；但若当时标准未明确禁止，则可能不构成违法或违纪，单位需谨慎处理，避免滥用权力。

建议：无论属于哪种情形，被举报人应第一时间配合单位调查，如实说明情况，并主动提供证据（如真实体检报告、医院证明、同事证言等）；若对处理结果不服，可通过内部申诉或法律途径维权。单位在处理时也需严格遵循法定程序，保障被举报人的陈述、申辩权，避免程序违法导致处理无效。

如有进一步细节（如举报内容、单位处理进展等），可直接向我咨询，我会结合具体情形为您详细分析。