如果工伤只赔偿了一部分，剩余部分应当向用人单位或者工伤保险基金申请赔偿，具体取决于未赔偿部分的性质和原因。以下是对此问题的详细分析：
一、明确赔偿主体
用人单位：
- 根据《工伤保险条例》及相关法律法规，用人单位应当为职工缴纳工伤保险费，并在职工发生工伤时承担相应的赔偿责任。
- 如果用人单位未依法缴纳工伤保险费，或者工伤保险基金未覆盖的赔偿项目（如停工留薪期工资、一次性伤残就业补助金等），应由用人单位承担赔偿责任。
工伤保险基金：
- 工伤保险基金是由用人单位缴纳的工伤保险费组成的，用于支付工伤职工的医疗费用、康复费用、一次性伤残补助金等。
- 如果工伤保险基金已经支付了部分赔偿，但仍有部分未支付（如因计算错误、遗漏项目等原因），工伤职工可以向工伤保险基金申请补足剩余部分。
二、分析未赔偿原因
赔偿项目未覆盖：
- 工伤赔偿包括多个项目，如医疗费、康复费、停工留薪期工资、一次性伤残补助金、一次性工伤医疗补助金、一次性伤残就业补助金等。
- 如果用人单位或工伤保险基金只赔偿了部分项目，而遗漏了其他项目，工伤职工可以要求补足剩余项目。
赔偿金额计算错误：
- 工伤赔偿金额的计算涉及多个因素，如工伤等级、工资水平、地区标准等。
- 如果用人单位或工伤保险基金在计算赔偿金额时出现错误，导致赔偿金额不足，工伤职工可以要求重新计算并补足差额。
用人单位未履行赔偿义务：
- 如果用人单位在工伤发生后未依法履行赔偿义务，或者拒绝支付剩余赔偿金额，工伤职工可以通过法律途径维护自己的权益。
三、申请赔偿的流程
与用人单位协商：
- 工伤职工可以首先与用人单位进行协商，要求用人单位支付剩余赔偿金额。
- 协商过程中，工伤职工可以提供相关证据（如工伤认定书、医疗费用发票、工资单等）来支持自己的主张。
向劳动争议仲裁委员会申请仲裁：
- 如果协商无果，工伤职工可以向当地的劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
- 仲裁委员会将依法进行调解或裁决，要求用人单位支付剩余赔偿金额。
向人民法院提起诉讼：
- 如果仲裁结果不满意或用人单位不履行仲裁裁决，工伤职工可以向人民法院提起诉讼。
- 法院将依法审理案件，并作出判决要求用人单位支付剩余赔偿金额。
四、注意事项
保留相关证据：
- 工伤职工在申请赔偿过程中，应保留好相关证据（如工伤认定书、医疗费用发票、工资单、协商记录等），以便在需要时提供证明。
及时申请：
- 工伤职工应在知道或应当知道自己的权益受到侵害之日起一年内申请仲裁或提起诉讼，以免超过时效期限而丧失维权机会。
寻求专业帮助：
- 如果工伤职工在申请赔偿过程中遇到困难或疑问，可以寻求专业律师的帮助，以确保自己的权益得到充分保障。
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