结论：单位跟员工签停薪留职协议时未告知特殊工种事务，若因此影响员工退休，单位可能需要承担一定的责任，具体责任需根据实际情况判断。以下从多个角度进行分析：
一、单位未履行告知义务的法律责任
合同义务角度：
- 停薪留职协议作为劳动合同的一种特殊形式，单位在签订时应当遵循诚实信用原则，全面、真实地告知员工与协议相关的所有重要信息，包括特殊工种事务对退休的影响。
- 若单位未履行告知义务，导致员工在不知情的情况下签订了协议，并因此影响了退休权益，单位可能构成违约，需要承担相应的违约责任。
劳动法保护角度：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，劳动者享有获得劳动安全卫生保护、享受社会保险和福利等权利。
- 特殊工种事务往往与劳动者的退休年龄、退休待遇等密切相关，单位有义务确保员工了解并知晓这些信息，以便员工做出合理的职业规划和退休安排。
- 若单位未履行告知义务，侵犯了员工的知情权，员工有权要求单位承担相应的法律责任。
二、影响退休的具体情形及责任承担
特殊工种认定与退休年龄：
- 特殊工种通常指从事井下、高空、高温、特别繁重体力劳动或者其他有害身体健康的工作。
- 根据相关规定，特殊工种的劳动者可以提前退休，并享受相应的退休待遇。
- 若单位未告知员工特殊工种事务，导致员工未能及时申请特殊工种认定或错过提前退休的机会，单位可能需要承担一定的责任。
退休待遇损失：
- 若因单位未告知特殊工种事务，导致员工退休后待遇降低或无法享受应有的退休待遇，员工有权要求单位赔偿相应的损失。
- 赔偿范围可能包括退休金差额、医疗保险待遇损失等，具体数额需根据实际情况计算。
三、员工维权途径与建议
协商解决：
- 员工可以首先与单位进行协商，要求单位承认错误并承担相应的责任。
- 协商过程中，员工可以提出具体的赔偿要求，如退休金差额补偿、医疗保险待遇恢复等。
劳动仲裁：
- 若协商无果，员工可以向当地劳动仲裁机构申请劳动仲裁。
- 劳动仲裁机构将根据双方提供的证据和法律规定，对争议进行裁决。
法律诉讼：
- 若对劳动仲裁结果不满，员工还可以向人民法院提起诉讼。
- 法院将依法审理案件，并作出最终判决。
建议：员工在签订停薪留职协议时，应仔细阅读协议内容，特别是与特殊工种事务相关的条款。如有疑问，应及时向单位咨询并要求解释。若单位未履行告知义务，员工应保留相关证据，以便在维权时使用。同时，员工也可以直接向我咨询，我会根据具体情况为你提供更详细的法律建议。