结论：公司因没有活放假13天后上班扣工资的行为，一般是不合法的，但具体还需根据实际情况和当地规定来判断。以下从多个角度进行分析：
一、法律原则与规定
工资支付原则：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，劳动者提供了正常劳动，用人单位应当按照劳动合同约定的工资标准支付工资。
- 工资是劳动者劳动的报酬，用人单位不得随意克扣或拖欠。
放假期间的工资支付：
- 如果公司因生产经营需要安排劳动者放假，且放假期间劳动者未提供劳动，那么公司是否需要支付工资，以及支付多少工资，可能需要根据当地的具体规定或劳动合同的约定来确定。
- 一般来说，如果放假是由于公司原因（如订单减少、设备维修等），且非劳动者原因造成的，公司应当支付劳动者一定的生活费或基本工资，具体标准可能因地区而异。
二、具体情境分析
公司单方面扣工资：
- 如果公司未经劳动者同意，单方面决定在放假后扣工资，这很可能构成违法行为。因为工资是劳动者应得的报酬，公司无权随意克扣。
劳动合同或规章制度中有约定：
- 如果劳动合同或公司的规章制度中明确规定了放假期间的工资支付方式，且该规定不违反法律法规的强制性规定，那么公司可能按照约定执行。但即便如此，如果约定明显不合理或损害劳动者权益，劳动者也有权提出异议。
当地有特殊规定：
- 某些地区可能对放假期间的工资支付有特殊规定，如支付最低工资标准的一定比例等。在这种情况下，公司需要遵守当地的规定。
三、法律建议
与公司协商：
- 如果公司扣除了你的工资，你可以首先尝试与公司进行协商，了解扣工资的具体原因和依据，并表达你的异议和诉求。
向劳动监察部门投诉：
- 如果协商无果，你可以向当地的劳动监察部门投诉，请求他们介入调查并处理。劳动监察部门有权对公司的违法行为进行查处，并要求公司补发工资。
申请劳动仲裁或提起诉讼：
- 如果劳动监察部门的处理结果不能满足你的诉求，你还可以向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，或者向人民法院提起诉讼，通过法律途径维护自己的合法权益。
四、注意事项
- 在处理此类问题时，建议你保留好相关的证据，如劳动合同、工资条、放假通知等，以便在需要时提供证明。
- 同时，你也可以咨询当地的劳动法律专业人士或律师，以获取更具体和专业的法律建议。
总结：公司因没有活放假13天后上班扣工资的行为，一般是不合法的。但具体还需根据劳动合同的约定、当地的规定以及实际情况来判断。如果你遇到了此类问题，建议先与公司协商，协商无果后再考虑向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁等法律途径来维护自己的权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。