结论：公司让未纳税的员工申报退税，这一行为本身并不合法，且可能涉及税务违规和法律责任。以下从多个角度进行详细分析：

1. 税务合规性角度：

   • 根据我国税收法律法规，退税是针对已经缴纳税款且符合退税条件的纳税人进行的。如果员工并未实际缴纳税款，那么其就不具备退税的资格。公司要求未纳税的员工申报退税，显然违反了税收法律法规的基本原则，即退税必须基于实际缴纳税款的前提。
   • 税务机关在审核退税申请时，会严格核查纳税人的纳税记录和退税条件。如果发现公司存在指使未纳税员工申报退税的行为，税务机关有权对公司进行税务处罚，包括但不限于罚款、加收滞纳金等。

2. 公司法律责任角度：

   • 公司作为法人实体，有义务遵守国家税收法律法规，确保员工的税务合规。如果公司指使未纳税员工申报退税，不仅可能面临税务机关的处罚，还可能因违反公司法、税法等相关法律法规而承担法律责任。
   • 在极端情况下，如果公司的行为构成犯罪（如逃税罪），公司及其相关责任人员还可能面临刑事处罚。

3. 员工个人风险角度：

   • 对于被公司要求申报退税的未纳税员工来说，他们也可能面临一定的法律风险。如果员工明知自己未纳税而仍然按照公司要求申报退税，可能构成协助逃税的行为，从而面临税务机关的处罚。
   • 此外，员工的个人信用记录也可能因此受到影响，对未来的贷款、信用卡申请等金融活动产生不利影响。

4. 实际操作建议：

   • 对于公司而言，应严格遵守国家税收法律法规，确保员工的税务合规。如果公司发现存在未纳税员工，应及时提醒并协助其完成纳税义务，而不是指使其申报退税。
   • 对于员工而言，如果公司要求其申报退税而自己并未纳税，应坚决拒绝并向上级或税务机关反映情况。同时，员工也应增强自身的税务意识，了解并遵守国家税收法律法规。

总结与启示：公司让未纳税的员工申报退税是不合法的行为，可能涉及税务违规和法律责任。公司和员工都应严格遵守国家税收法律法规，确保税务合规。如果遇到相关问题或疑虑，建议直接向我咨询，我将根据具体情况提供专业的法律意见和解决方案。