结论：公司不帮员工申请个人所得税本身并不直接违法，但公司有义务履行代扣代缴义务，若未履行则可能面临法律责任。

1. 公司不“帮”员工申请个人所得税的表述需澄清：

   • 实际上，个人所得税的申报和缴纳是员工的法定义务，但根据《中华人民共和国个人所得税法》及其实施条例，公司作为支付所得的单位，有义务作为扣缴义务人，代扣代缴员工的个人所得税。
   • “不帮员工申请”可能指的是公司不主动为员工办理申报手续或未履行代扣代缴义务，这并不等同于员工可以免除纳税义务，而是公司可能未尽到其法律责任。

2. 公司的代扣代缴义务：

   • 根据法律规定，公司向员工支付工资、薪金等所得时，应依法计算并代扣代缴个人所得税，将税款及时上缴国库。
   • 若公司未履行代扣代缴义务，税务机关有权对公司进行处罚，包括但不限于罚款、加收滞纳金等，并可能影响公司的纳税信用等级。

3. 员工的权利与义务：

   • 员工有义务如实申报自己的所得，并缴纳应纳税款。即使公司未代扣代缴，员工仍需自行向税务机关申报并缴纳税款，否则可能面临税务机关的追缴、罚款等法律责任。
   • 员工有权要求公司履行代扣代缴义务，并在公司未履行时向税务机关举报。

4. 特殊情况下的处理：

   • 如果员工与公司就纳税问题存在争议，或公司确实存在未代扣代缴的情况，员工可以与公司协商解决，或向税务机关咨询、举报。
   • 税务机关在接到举报或发现公司未履行代扣代缴义务时，会依法进行调查处理，并保护员工的合法权益。

建议：

• 对于员工而言，应了解自己的纳税义务，并关注公司是否履行了代扣代缴义务。如发现问题，应及时与公司沟通或向税务机关举报。
• 对于公司而言，应严格遵守税收法律法规，履行代扣代缴义务，避免因此产生的法律风险和声誉损失。

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