结论：交通事故工伤期间公司停发工资是否合理，需分情况讨论。若员工被认定为工伤且处于停工留薪期，公司停发工资是不合理的；若员工未被认定为工伤或停工留薪期已满，公司停发工资则可能具有合理性，但需遵循相关法律法规和公司规定。
分析：
工伤认定与停工留薪期：
- 根据《工伤保险条例》的规定，员工在工作时间和工作场所内，因工作原因受到事故伤害的，应当认定为工伤。一旦被认定为工伤，员工将享受工伤保险待遇，其中包括停工留薪期内的工资福利。
- 停工留薪期是指员工因工伤需要暂停工作接受治疗的期间。在这个期间内，公司应当按照原工资福利待遇支付员工工资，不得停发或降低。
公司停发工资的合理性分析：
- 若员工被认定为工伤且处于停工留薪期：公司停发工资是不合理的。因为根据法律规定，公司有义务在停工留薪期内支付员工原工资福利待遇。如果公司停发工资，员工可以通过法律途径维护自己的权益，如向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
- 若员工未被认定为工伤：则公司停发工资可能具有合理性。因为非工伤情况下，员工不享受工伤保险待遇，公司无需支付停工留薪期内的工资。但此时，如果员工因交通事故导致无法工作，且存在误工损失，可以根据交通事故责任认定和赔偿规定，向事故责任方主张误工费赔偿。
- 若停工留薪期已满：员工仍需继续治疗或无法从事原工作，此时公司停发工资的合理性需根据具体情况判断。如果员工能够证明自己因工伤导致无法工作，且公司未提供适当的工作岗位或调整工资待遇，员工可以与公司协商或寻求法律援助。
法律建议：
- 对于员工而言，如果发生交通事故并被认定为工伤，应及时向公司提出停工留薪期的申请，并保留好相关医疗证明和工伤认定文件。如果公司停发工资，可以与公司沟通协商，或向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁。
- 对于公司而言，应严格遵守法律法规，在员工被认定为工伤且处于停工留薪期内时，按时足额支付员工工资。如果员工停工留薪期已满但仍需继续治疗或无法从事原工作，公司应与员工协商解决方案，避免引发劳动争议。
额外提醒：
- 交通事故工伤的赔偿问题可能涉及多个方面，包括工伤保险待遇、交通事故责任赔偿等。员工在处理此类问题时，应全面了解自己的权益和义务，必要时寻求专业法律帮助。
- 如果员工对公司停发工资的行为有异议，或者对工伤认定、停工留薪期等有疑问，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供详细的法律建议和帮助。