针对您提出的“员工怀孕就不来上班了怎么处理”这一问题，我会从法律法规、公司制度以及实际操作层面为您详细解答。
一、初步沟通与核实情况
首先，公司应当主动与员工取得联系，通过温和关切的方式询问其不上班的具体原因及身体状况。这一步骤至关重要，它体现了公司对员工的关心和支持，同时也有助于我们准确了解员工的实际情况。在沟通过程中，可以要求员工提供医院诊断书、病假条等必要证明材料，以确认其请假需求的合理性。
二、根据具体情况采取相应措施
病假处理：
- 如果员工提供了正规医院开具的病假条，并且符合公司的病假申请流程，那么公司应当依法按照病假来处理。根据相关规定，病假工资或疾病救济费不得低于当地最低工资标准的80%。同时，公司也需要明确员工享有的病假期限，如果员工长期休病假超过规定期限，需要进一步与员工沟通协商。
产假安排：
- 女职工生育享受至少98天的产假，难产或多胞胎生育还可以增加产假天数。各地可能还有额外的奖励政策，公司需要准确了解并告知员工。在产假申请方面，公司应确保员工知晓所需的材料和流程，如填写申请表、提供预产期证明等。
旷工管理：
- 如果员工无正当理由且未履行请假手续而一直不上班，那么公司可以认定为旷工。在处理旷工时，公司必须严格遵循公司规章制度和法律法规，确保有充分证据证明旷工事实，并已履行必要的通知程序。
三、协商灵活解决方案
灵活工作安排：
- 考虑到员工怀孕的身体状况，公司可以与员工协商灵活的工作安排，如远程办公等。这样既能满足员工的需求，又能保证工作的正常进行。双方应签订相关协议明确细节，以确保双方的权益。
职业发展规划调整：
- 根据员工的身体状况和工作能力，公司可以与员工共同探讨职业发展规划的调整。例如，暂时调整工作岗位至强度较低、压力较小的岗位，并确保薪酬待遇合理公平。
四、严格遵守法律法规，避免违法解雇
- 我要特别强调的是，根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关法律法规，女职工在孕期、产期、哺乳期内，用人单位不得随意解除劳动合同。除非员工存在严重违反公司规章制度或法律规定的行为，如严重违反劳动纪律、严重失职或营私舞弊导致公司遭受重大损害等。因此，公司在处理怀孕员工不上班的问题时，必须严格遵守法律法规，避免违法解雇带来的法律风险和声誉损失。
五、寻求专业法律支持
- 在处理过程中，如果公司遇到复杂情况或难以抉择的问题，建议咨询专业劳动法律师，获取更具针对性的建议和指导。这样可以确保公司的处理方式既合法又合理，有效维护公司与员工的合法权益。
综上所述，对于员工怀孕后一直不上班的情况，公司应综合考虑法律法规、公司制度以及员工实际情况，通过沟通、协商和必要时的法律支持来妥善处理此类问题。