结论前置：公司罚款单签字了，依然可以申请劳动仲裁。签字行为本身并不直接剥夺你申请仲裁的权利，但具体能否胜诉需结合罚款的合法性、合理性及证据情况综合判断。以下从不同角度详细分析：

1. 罚款单签字的法律意义

• 签字不等于认可合法性：签字仅表明你“收到”或“知晓”罚款单内容，但并不等同于承认罚款的合法性或合理性。若罚款本身违反法律规定（如超出法定范围、无制度依据等），你仍有权通过仲裁主张权利。
• 例外情形：若罚款单中明确载明“签字即视为同意罚款”等条款，且你签字时未提出异议，可能被推定为对罚款的认可。但此类条款若显失公平（如罚款金额过高），仍可能被仲裁机构或法院撤销。

2. 公司罚款的合法性审查

• 法律依据：根据《劳动合同法》及相关规定，用人单位仅在以下情形下可对劳动者进行经济处罚：
  1. 制度依据：罚款需基于合法有效的规章制度（如经民主程序制定、公示或告知劳动者）；
  2. 范围限制：罚款金额不得超过当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地最低工资标准；
  3. 事由合理：罚款需针对劳动者严重违反规章制度或造成重大损失的行为，且与过错程度相当。
• 常见违法情形：
  • 无制度依据或制度未公示；
  • 罚款金额超出法定比例；
  • 以罚款代替正常管理（如因迟到、未穿工装等轻微违纪罚款）；
  • 罚款后未出具书面凭证或未告知劳动者申诉途径。

3. 申请仲裁的流程与证据

• 仲裁时效：自你知道或应当知道权利被侵害之日起1年内提出（如收到罚款单之日）。
• 关键证据：
  1. 罚款单原件（证明公司实施了罚款行为）；
  2. 工资条或银行流水（证明罚款实际扣除）；
  3. 公司规章制度（证明罚款是否合法）；
  4. 其他证据（如同事证言、录音录像等，证明罚款事由不成立或程序违法）。
• 仲裁请求：可主张返还违法扣除的罚款、补发工资差额，甚至要求公司支付赔偿金（如罚款导致解除劳动合同且公司违法）。

4. 可能的风险与应对

• 公司反诉：若公司主张罚款合法，可能提供制度依据、劳动者违纪证据等。此时需针对性反驳（如制度未公示、罚款金额过高、证据不足等）。
• 调解建议：仲裁前可尝试与公司协商，若公司同意返还罚款或调整金额，可签订书面和解协议，避免仲裁耗时。

5. 实务建议

• 及时行动：若认为罚款违法，尽快收集证据并申请仲裁，避免超过时效；
• 专业协助：劳动仲裁涉及程序和实体双重审查，建议委托律师起草仲裁申请书、整理证据，提高胜诉率；
• 保留沟通记录：与公司协商时，尽量通过书面形式（如邮件、短信）留存记录，作为后续证据。

总结：签字不影响仲裁权利，但需结合罚款合法性、证据充分性综合判断。若公司罚款违法，你有权通过仲裁追回损失。如有具体案情或证据问题，可直接向我咨询，我会进一步分析并提供针对性建议。