“以征代租”建厂房的行为是不合法的。以下从多个角度对此进行详细分析：
一、核心概念界定与行为性质
“以征代租”并非一个法律术语，但从字面意思理解，它可能指的是通过征收土地的方式，实际上却以租赁的形式使用土地来建设厂房。这种行为本质上是一种土地用途的非法转变，试图通过征收的合法外衣掩盖农用地向建设用地的实质转化，且可能未按照法定程序进行土地征收和补偿。
二、法律规定与违法性分析
违反土地用途管制：
- 法律依据：根据《中华人民共和国土地管理法》第四条，国家严格实行土地用途管制，保护耕地，限制农用地转为建设用地。
- 违法点：“以征代租”若未经批准擅自改变土地用途，将农用地用于非农业建设（如建厂房），直接违反了土地用途管制制度。
规避审批程序：
- 法律依据：同样根据《中华人民共和国土地管理法》，农用地转为建设用地及土地征收均需经过严格的审批程序。
- 违法点：“以征代租”可能绕过了这些法定审批程序，如未进行农用地转用审批、未办理土地征收手续等，构成违法。
合同无效风险：
- 即使存在某种形式的“征收”或“租赁”合同，若合同内容（如将农用地用于非农业建设）违反了法律法规的强制性规定，该合同也是无效的。
三、现实危害
农民利益受损：
- “以征代租”可能导致农民无法获得应有的土地征收补偿，而仅以低租金形式出租土地，收益大幅减少。同时，农民可能面临土地复垦困难和长期生产生活影响。
国家粮食安全受威胁：
- 耕地面积的减少会直接影响粮食种植和生产，进而威胁国家粮食安全。
土地市场秩序破坏：
- “以征代租”行为扰乱了正常的土地市场秩序，影响了公平竞争和健康发展。
四、合法途径与建议
合法征收与补偿：
- 若确实需要征收土地用于非农业建设（如建厂房），应严格按照法定程序进行土地征收，并给予农民合理的补偿。
租赁合法土地：
- 若仅需租赁土地进行非农业建设，应确保租赁的土地符合土地利用总体规划和城乡规划，且已办理相关审批手续。
咨询与审查：
- 在进行任何土地征收或租赁行为前，务必咨询专业律师或相关部门，确保行为的合法性。同时，对土地的性质、规划、审批手续等进行全面审查。
五、法律后果
若“以征代租”行为被认定为违法，可能面临以下法律后果：
- 行政处罚：相关部门可能对违法行为人处以罚款、没收违法所得等行政处罚。
- 民事赔偿：若因违法行为给农民或其他主体造成损失，需承担相应的民事赔偿责任。
- 刑事责任：在严重情况下，如涉及非法占用农用地罪等，可能面临刑事追究。
总结与建议：
“以征代租”建厂房的行为是不合法的，它违反了土地用途管制制度，规避了审批程序，损害了农民利益，威胁了国家粮食安全，并破坏了土地市场秩序。因此，建议在进行相关行为时，务必确保合法性，并咨询专业律师或相关部门进行审查。若您有任何关于征地拆迁或土地租赁的法律问题，欢迎直接向我咨询。