以租代征学校为厂房的行为是违法的。以下从几个方面为你详细分析：

一、法律背景与规定

“以租代征”是指通过租用农村集体土地进行非农业建设，擅自扩大建设用地规模的行为。这种行为规避了法定的农用地转用和土地征收审批程序，违反了土地管理法律、法规的强制性规定。根据《中华人民共和国土地管理法》的相关规定，任何单位和个人进行建设，需要使用土地的，必须依法申请使用国有土地；涉及农用地转为建设用地的，应当办理农用地转用审批手续。因此，“以租代征”行为本身就不合法，更不用说将学校用地（通常属于教育用地，具有特定的土地用途）通过“以租代征”的方式转变为厂房用地了。

二、具体违法性分析

1. 土地用途变更违法：学校用地通常规划为教育用地，其用途是明确的。未经法定程序，擅自改变土地用途，将学校用地转变为厂房用地，违反了土地用途管制制度。

2. 规避审批程序：“以租代征”行为往往绕过了农用地转用和土地征收的法定审批程序，这种规避行为破坏了土地管理的正常秩序，损害了国家土地管理权力的行使。

3. 可能涉及其他违法行为：在“以租代征”过程中，还可能伴随有非法占用土地、破坏耕地、非法转让土地使用权等违法行为，这些行为都受到法律的严格禁止。

三、法律后果与风险

1. 行政处罚：对于“以租代征”行为，土地管理部门有权依法进行查处，包括责令退还非法占用的土地、限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施、恢复土地原状等，并可以处以罚款。

2. 刑事责任：如果“以租代征”行为情节严重，构成犯罪的，还将依法追究刑事责任。例如，非法占用农用地罪等。

3. 合同无效风险：以“以租代征”方式签订的土地租赁合同，因违反法律、行政法规的强制性规定而无效。这意味着，一旦合同被认定无效，双方将无法依据合同主张权利，还可能因此承担损失赔偿责任。

四、建议与措施

1. 立即停止违法行为：如果已经存在“以租代征”学校为厂房的行为，建议立即停止，并尽快恢复土地原状，以避免进一步的法律风险和损失。

2. 咨询专业律师：在处理此类复杂法律问题时，建议咨询专业律师的意见。律师可以根据具体情况提供针对性的法律建议和解决方案，帮助你更好地应对法律风险和挑战。

3. 遵守法律法规：在未来的土地使用和开发过程中，务必严格遵守相关法律法规的规定，确保土地使用的合法性和合规性。

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