公司使用员工身份证申请专利是否违法，需分情况讨论：
若员工不知情或未授权：
- 法律背景：根据《中华人民共和国居民身份证法》的相关规定，任何组织或者个人不得扣押居民身份证，也不得冒用他人居民身份证。公司若未经员工同意，擅自使用其身份证申请专利，属于冒用他人身份证的行为，违反了该法律条款。
- 法律后果：公司可能面临行政处罚，包括但不限于罚款、警告等。同时，员工有权要求公司停止侵权行为，并可能因此遭受的名誉损失、精神损害等提起民事诉讼，要求公司承担相应的赔偿责任。
若员工知情并授权：
- 法律背景：在员工知情并明确授权的情况下，公司使用其身份证申请专利，并不直接违反《中华人民共和国居民身份证法》。但此时需关注专利申请的实质性要求，即专利申请应基于真实的发明创造，且申请人（或发明人）应与实际的发明创造者相符。
- 潜在风险：即便员工知情并授权，若专利申请中的发明创造并非员工实际完成，而是公司或其他人员完成的，这可能涉及专利申请的虚假陈述或欺诈行为，一旦被发现，专利申请可能被驳回，已授予的专利也可能被宣告无效。此外，若员工因此被卷入专利纠纷或法律诉讼，可能对其个人声誉和职业发展造成不利影响。
法律建议：
- 对于公司：应严格遵守法律法规，不得擅自使用员工身份证申请专利。若需以员工名义申请专利，应事先获得员工的明确授权，并确保专利申请的实质性要求得到满足。
- 对于员工：应保护好自己的身份证信息，不得随意授权他人使用。若发现公司未经授权使用其身份证申请专利，应及时向公司提出异议，并保留相关证据，以便在必要时维护自己的合法权益。
后续行动指导：
- 若您或您的公司面临此类问题，建议首先收集相关证据，包括但不限于身份证使用记录、专利申请文件、授权书等。
- 接着，可以尝试与公司进行协商，寻求和解或达成补偿协议。
- 若协商无果，您可以考虑向相关部门（如市场监管部门、知识产权局等）投诉或举报公司的违法行为。
- 在必要时，您还可以寻求法律援助或提起民事诉讼，以维护自己的合法权益。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。