综合工时制下，加班费半年发放一般是不合法的。以下从几个方面为你详细分析：

法律规定层面

根据《工资支付暂行规定》第七条，工资必须在用人单位与劳动者约定的日期支付。如遇节假日或休息日，则应提前在最近的工作日支付。工资至少每月支付一次，实行周、日、小时工资制的可按周、日、小时支付工资。这一规定明确了工资支付的周期，通常理解为按月支付，对于加班费，同样应遵循这一支付周期原则，即加班费也应当至少每月支付一次，以确保劳动者的合法权益得到及时保障。

综合工时制特点与加班费支付

综合工时制是一种特殊的工作时间制度，它是以标准工作时间为基础，以一定的期限为周期，综合计算工作时间的工时制度。在综合工时制下，劳动者在周期内的总工作时间如果超过法定标准工作时间，超出部分应视为加班，用人单位需支付加班费。然而，这并不意味着加班费可以随意延迟支付。加班费作为劳动者劳动报酬的一部分，其支付同样应遵循工资支付的相关规定，即至少每月支付一次。

半年发放加班费的潜在问题

1. 损害劳动者权益：半年发放一次加班费，意味着劳动者在较长时间内无法获得应得的劳动报酬，这可能影响劳动者的生活质量和经济状况，损害劳动者的合法权益。
2. 增加用人单位风险：延迟支付加班费可能引发劳动者的不满和投诉，甚至可能导致劳动争议和法律纠纷，增加用人单位的法律风险和经营成本。
3. 违反法律法规：如前所述，半年发放一次加班费违反了工资支付的相关规定，用人单位可能因此面临劳动行政部门的处罚和劳动者的法律诉讼。

建议与措施

1. 及时支付加班费：用人单位应严格按照法律法规的规定，至少每月支付一次加班费，确保劳动者的合法权益得到及时保障。
2. 完善内部管理制度：用人单位应建立健全内部管理制度，明确加班费的计算方法和支付时间，避免出现延迟支付或漏发加班费的情况。
3. 加强沟通与协商：用人单位应与劳动者加强沟通与协商，就加班费的支付问题达成共识，确保双方权益得到平衡和保障。

如果你遇到了综合工时制下加班费半年发放的情况，或者对此有任何疑问和困惑，都可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律意见和帮助。