合同到期公司不续签支付给员工的经济补偿是否需要扣税，主要取决于补偿金的数额与当地上年职工平均工资的比较。以下是详细分析：
一、免征个人所得税的情况
政策依据：
- 根据《财政部 税务总局关于个人所得税法修改后有关优惠政策衔接问题的通知》（财税〔2018〕164号）的规定，个人因与用人单位解除劳动关系而取得的一次性补偿收入（包括经济补偿金、生活补助费和其他补助费用），在当地上年职工平均工资3倍数额以内的部分，免征个人所得税。
具体实例：
- 假设某地区上年职工平均工资为50,000元，那么3倍数额即为150,000元。若公司支付给员工的经济补偿金不超过这个数额，如120,000元，则该员工无需就这笔补偿金缴纳个人所得税。
特殊情况：
- 如果补偿金是因工伤或患职业病而获得的，根据相关规定，这部分补偿金将全部免征个人所得税，不受上述3倍数额的限制。
二、需要缴纳个人所得税的情况
超过规定数额部分需缴税：
- 当补偿金超过当地上年职工平均工资3倍数额时，超出部分将需要按照综合所得税率表单独计算并缴纳个人所得税。
计算方法：
- 超出部分的一次性补偿收入，除以个人在本企业的工作年限数（超过12年的按12年计算），以其商数作为个人的月工资、薪金收入，然后依据综合所得税率表计算应缴纳的税额。具体计算公式可以简化为：应纳税额 = 超过3倍数额部分的一次性补偿收入 × 适用税率 - 速算扣除数。其中，适用税率和速算扣除数根据应纳税所得额的不同区间而有所差异。
具体实例：
- 继续以上述地区为例，若公司支付给员工的经济补偿金为200,000元，则超出3倍数额的部分为50,000元（200,000 - 150,000）。假设这50,000元对应的适用税率为10%，速算扣除数为2520元，则应纳税额为：50,000 × 10% - 2520 = 2480元。
三、注意事项与实际操作建议
补偿金计算方式：
- 经济补偿金通常根据劳动者在本单位工作的年限来计算，具体为每满一年支付一个月工资的标准。对于六个月以上不满一年的情况，按一年计算；不满六个月的，则向劳动者支付半个月工资的经济补偿。这里的“月工资”指的是劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。
地区差异考虑：
- 由于各地区的职工平均工资水平存在差异，因此判断补偿金是否需要扣税以及具体的扣税标准时，必须结合当地的具体规定来执行。
税务申报与缴纳：
- 在收到补偿金后，如确定有应税部分，劳动者应依法进行税务申报并及时缴纳相应的税款，以避免可能的税务风险。
总结来说，合同到期公司不续签支付给员工的经济补偿是否需要扣税，关键在于补偿金的数额是否超过了当地上年职工平均工资的3倍。如果未超过，则无需扣税；如果超过，则超出部分需要依法扣税。在处理此类问题时，建议劳动者仔细核对自己的补偿金额度，并根据当地税务规定进行相应的税务处理。如有任何疑问或不确定之处，可以直接向我咨询，我会为你提供准确的税务指导。